生信宝库

前言 对于很多小伙伴来说，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，即在基因组层面可以算突变率差异，转录组层面可以算基因表达水平差异，表观组可以观察甲基化水平差异，蛋白质组/代谢组...

JY_Liu

常用的分析方法： 过表征分析 (over representation analysis, ORA) ：先找出差异基因，再对差异基因进行如GO/KEGG等富集 基因富集分析 ...

学习生信的小兔子

What：什么是GO和KEGG？ GO全称是Gene Ontology，它分为：细胞组分（cellular component, CC）、分子功能（molecular fun...

假装_学霸

前沿 表观遗传学，包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RN...

若与

最近在复习python的科学计算，突然心血来潮，想看看R的数据处理和python的区别在哪，所以就有了这篇文章。 R语言简介 四十多年前， R 语言的始祖诞生了 ， John...

苏牧传媒

R：http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/exomePeak.html 安装：# 看来作者更新的挺好 ...

RaoZC

前些天，实验室里的同事，为了补充计算几个比较组合的差异分析，花了几千元，真够冤枉的。但碍于我们实验室对生信技术的鄙夷，我也懒得理睬。这里简单介绍一下如何使用edgeR进行差异...

生信学霸

01—研究背景 上一篇公众号我们为大家详细的介绍了R软件包limma筛选差异基因，limma包做差异分析要求数据满足正态分布或近似正态分布，如基因芯片、TPM格式的高通量测序...

美式永不加糖

菜🐣的第一次正式上手R，相当于翻译了 edgeR 这个包的 UserGuide，跑了第一个 case眼看写了这么多字，还是发一下比较好，万一有人看呢 edgeR简介 edge...