我们今天学习如何利用complexheatmap添加缩放和链接注释，以及如何加入词云图等。 前面我们测试过，热图中有很多行或列，但是我们只想标记其中的一些情况，用的是anno...
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【R画图学习24.5】ComplexHeatmap缩放和链接注释 -
gemoma安装与简单用法
gemoma是根据已知参考基因组的注释，给未知基因组注释的软件，貌似网上仅仅有提到，却没有具体的用法，笔者研究了一下，写下以下傻瓜式攻略，给大家参考安装很简单，直接用cond...
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ggplot2绘制棒棒糖图——Lollipop chart棒棒糖图，就是长得像棒棒糖一样的图（一句废话），和柱形图，散点图想要表达的意思是一致的，不过展示会更加好看一点，是点图geom_point()和堆叠图geom_segment...
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你不知道的减数分裂中的秘密——轴蛋白ASY1/3对同源多倍体减数分裂染色体行为的影响本文主要介绍一篇名为Derived alleles of two axis proteins affect meiotic traits in autotetraploid ...
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浅谈多倍体概念以及多倍体形成的几种途径多倍体，拥有三套及三套以上完整染色体组的生物体。 根据多倍体是否经历或已经完成二倍体化，可以将多倍体分为古多倍体 (paleopolyploid) 和近多倍体 (neopol...
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Circos安装出问题?这个安装组合能一键成功安装CircosCircos安装感觉一直是个难题，各种模块总会这里少一个那里少一个。最近在学习另外一个软件时发现安装下面这个版本去安装Circos以及几个perl模块，只需要一步即可安装成功...
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sed将多行fasta变为一行
需要处理的fasta文件： 目标是把序列变为一行,并且第一行只保留ID 先把第一行删除，将剩下内容的换行符全部删除，最后把第一行内容补上,添加的内容也可以为变量 输出：
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跟着Nature Communications学作图：R语言UpSetR画图展示不同组数据之间的交集论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
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gff中的负链如何理解在我们得到SNP位点的VCF文件，想要查看某个SNP位点其在蛋白序列哪一个位点，以了解该位点氨基酸突变的情况时，遇到gff为负链的情况而和我们VCF所给位置信息对不上，为了解...
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跟着 Nature Communication 学作图 | 百分比堆积柱状图+卡方检验跟着 Nature Communication 学作图 | 百分比堆积柱状图+卡方检验 今天我们复现一幅2021年6月发表在nature communications上的热图...
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用samtools+bedtools快速计算不同区域中的变异数量（滑动窗口）
在做生物信息分析时，我们经常会用到滑动窗口统计不同区间内的变异数量，但是对于生物信息初学者（不具备编程能力）存在一定难度，这里有简单便捷实现滑动窗口的方法。 通过samtoo...
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用python合并RepeatMasker预测结果中染色体的overlap区域
前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件，可以筛选DNA序列中的散在重复序列和低复杂序列，是重复序列注释的重要软件。 问题 我们想对RepeatM...
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UpSetR：集合可视化神包对于集合的可视化，第一时间想到的都是韦恩图（venn diagram），一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加，比如说五个的时候，你就很难从图中解...
