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R-ggplot2-如何将点图与密度统计图通过双坐标轴的方式结合在一起？本篇给出解决方案~目录 0.问题导入 1.示例数据 2.导入示例数据 3.离散类型连续化 4.绘图数据框构建 5.将密度图与点图叠加（图2） 6.总结 7.本文所使用的R-packages（没...
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每周文献 2021-06-05大家好，本周我分享的文献是一篇关于结合环境指标解释和预测作物表型的研究。 文章题目：An integrated framework reinstating the envir...
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R 数据可视化 —— circlize 和弦图前言 和弦图可以用连接线或条带的方式展示不同对象之间的关系 和弦图主要从以下几个层面来展示关系信息： 连接，可以直接显示不同对象之间存在关系 连接的宽度与关系的强度成正比 连...
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R绘图(6): 拯救初学者——发表级绘图全能包ggpubr今天花了很多时间整理这个包的绘图函数，不得不说这个基于ggplot2的包，是真的友好，很适合初学者。可能对于熟悉ggplot2的人来说，ggpubr的存在有些多余，但这并不妨...
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跟着Cell学作图|10.复杂热图跟着Cell学作图|10.复杂热图 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032[https...
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TCGA差异分析——limma, DEseq2, edgeRTCGA转录组数据 转录组数据的差异分析与芯片数据的差异分析有不同，这里我们使用count数据，因为这几种包中包装了标准化的函数，只需要程序化的输入两个数据，count矩阵和...
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RNA-seq分析简洁版前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分析，不在赘述细节，所以有看细节...
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宏基因组，代谢组：高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的？测序行业的蓬勃发展，带来微生物组学日新月异的变化。目前，单一组学的文章不断“贬值”，前沿研究的目光从单一组学逐步拓展至多组学对贯穿分析，即结合多个组学的分析角度，从多个层面阐...
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单细胞转录组测序数据分析之拟时序分析简介鉴定好细胞类型后，我们还可以对其进行一些功能性分析，如拟时序分析和SCENIC分析，对细胞的生物学意义进行一定程度上的挖掘。本期小编主要为大家介绍拟时序分析（Pseudoti...
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R - 广义加性模型（GAM）构建详解：以归一化植被指数NDVI为例目录 0.问题导入 1.示例数据 2.数据导入及训练组/验证组拆分（70%/30%） 3.训练集NDVI~训练结果的相关性与时间演进分析 4.验证集NDVI~模型预测结果的相...
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本周最新文献速递2021-03-07
本周最新文献速递 一 文献题目： Population-scale single-cell RNA-seq profiling across dopaminergic neu...
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R语言画森林图展示Logistic回归分析的结果之前的推文参考《R语言实战》介绍了R语言做Logistic回归分析的简单小例子，今天的推文继续，介绍一些Logistic回归分析结果的展示方法。 在文献中，我们常常看到以表格...
