1.问题 应该是会经常遇到这样的热图，就是说它的聚类情况无法与分组信息吻合。其实这个并不是错了，是因为用于聚类的行（选出的这部分基因）的表达模式在两组之间没有明显区别。只要改...
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R-ggplot2-如何将点图与密度统计图通过双坐标轴的方式结合在一起？本篇给出解决方案~目录 0.问题导入 1.示例数据 2.导入示例数据 3.离散类型连续化 4.绘图数据框构建 5.将密度图与点图叠加（图2） 6.总结 7.本文所使用的R-packages（没...
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每周文献 2021-06-05大家好，本周我分享的文献是一篇关于结合环境指标解释和预测作物表型的研究。 文章题目：An integrated framework reinstating the envir...
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R 数据可视化 —— circlize 和弦图前言 和弦图可以用连接线或条带的方式展示不同对象之间的关系 和弦图主要从以下几个层面来展示关系信息： 连接，可以直接显示不同对象之间存在关系 连接的宽度与关系的强度成正比 连...
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R绘图(6): 拯救初学者——发表级绘图全能包ggpubr今天花了很多时间整理这个包的绘图函数，不得不说这个基于ggplot2的包，是真的友好，很适合初学者。可能对于熟悉ggplot2的人来说，ggpubr的存在有些多余，但这并不妨...
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跟着Cell学作图|10.复杂热图跟着Cell学作图|10.复杂热图 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032[https...
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TCGA差异分析——limma, DEseq2, edgeRTCGA转录组数据 转录组数据的差异分析与芯片数据的差异分析有不同，这里我们使用count数据，因为这几种包中包装了标准化的函数，只需要程序化的输入两个数据，count矩阵和...
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RNA-seq分析简洁版前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分析，不在赘述细节，所以有看细节...
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宏基因组，代谢组：高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的？测序行业的蓬勃发展，带来微生物组学日新月异的变化。目前，单一组学的文章不断“贬值”，前沿研究的目光从单一组学逐步拓展至多组学对贯穿分析，即结合多个组学的分析角度，从多个层面阐...
