山东第一医科大学， 青年教师一枚，三代测序技术爱好者。
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多组学流程开发
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目标序列捕获测序常见问题集锦转载：https://www.plob.org/article/1610.html目标序列捕获测序，是将感兴趣的基因组区域定制成特异性探针与基因组DNA进行杂交（固相或液相）...
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安捷伦探针液相杂交捕获原理文献这是Broad研究所和安捷伦公司合作于2009年在《nature biotechnology》发表的一篇文章 《使用超长寡核苷酸的液相杂交捕获应用于大规模平行靶向测序》 ，文...
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测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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NGS007 华大MGI测序1. 建库及全流程原理参考illumina测序介绍 NGS006 illumina测序 2. MGISEQ介绍 华大智造基因测序仪采用先进的DNBSEQTM测序核心技术，主要...
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2020-01-31 RNA-seq 链特异性文库 lncRNA 理解本次主要来理解一下什么是链特异性文库，为什么要构建这种文库。 首先要明确几个概念，对理解后面的讲解很有帮助： 基本概念 正链（forward strand）: 我们可以理解为...
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ATAC-seq分析干货-2
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATAC-Seq能帮助我们从全基因组范围内推测可能的开放染色质位点...
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FastQC“A quality control tool for high throughput sequence data.” FastQC是JAVA语言编写的能够对高通量测序数据进...
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NGS003 NGS接头我们在测序的过程中，需要构建含有接头序列的文库分子，对于我们大部分实验人员来说，只是知道接头连接是如何操作，但是对于接头的作用及结构可能并不太清楚，以illumina文库为例...
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单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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CPG岛
pG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一，而在基因组的某些区段，CpG保持或高于正常概率。CpG岛主要位于基因的启动子（promotor）和外显子区域，是富含CpG二核苷酸的...
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【目标区域捕获-2】目标区域捕获简介
1.背景 目标区域测序（Target region sequencing）是通过定制感兴趣的基因组区域的探针，与基因组DNA进行杂交，将目标区域DNA富集后进行高通量测序的研...
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全基因组扩增技术2021/03/09 全基因组扩增技术 Whole Genome Amplification，WGA DOP-PCR(Degenerate Oligonucleotide P...
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全基因组扩增方法汇总全基因组扩增技术（Whole genome amplification，WGA）能够实现对整个基因组的扩增以提供大量可供分析样品的技术 1.基于PCR 技术的WGA 方法 1...
