小范809

循环语句也可以写成一行，do后面直接加命令就行，不能用封号将do和command分开

Linux结构化语句-条件与循环

Linux结构化语句 条件语句 if循环语句: for 循环和 while循环 条件语句 if if 条件语句的常见格式如下，注意空格 有头有尾，一个if 就要对应一个 fi...

Ashu

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小范809

一、名词简介 grep （global search regular expression(RE) and print out the line,全面搜索正则表达式并把行打印...

小范809

@Chipcui 好的，谢谢😂

基于参考基因组的基因组组装和注释

将基因组组装到染色体水平无非就是两种方式： 独立组装（de novo）； 基于参考基因组的组装（reference-guided），即基于近缘或同一物种的基因组染色体同源性进...

Boer223

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小范809

我也喜欢用这个，可惜不可以云同步

typora-让你爱上Markdown，从此无法自拔

typora-让你爱上Markdown，从此无法自拔下载地址 for Windows[https://www.typora.io/#windows]其他系统可进typora官...

一个好汉

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小范809

你好，patch那一步的两个输入文件，一个是参考基因组一个是我们自己要修补的基因组文件吗？还是一个是我们的contig或是scaffolding文件另一个是我们要修补的基因组文件?

基于参考基因组的基因组组装和注释

将基因组组装到染色体水平无非就是两种方式： 独立组装（de novo）； 基于参考基因组的组装（reference-guided），即基于近缘或同一物种的基因组染色体同源性进...

Boer223

21225 16 43

小范809

将基因组组装到染色体水平无非就是两种方式： 独立组装（de novo）； 基于参考基因组的组装（reference-guided），即基于近缘或同一物种的基因组染色体同源性进...

小范809

禾本科：Gramineae 稻属：Oryza L. 尼瓦拉野生稻：Oryza nivara Sharma & Shastry 普通野生稻：Oryza rufipogon Gr...

小范809

你好，我使用mpi运行maker时总是报错，如下：
Primary job terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
--------------------------------------------------------------------------
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
SIGTERM received
--------------------------------------------------------------------------
mpiexec noticed that process rank 5 with PID 0 on node huangji-5885H-V5 exited on signal 11 (Segmentation fault).
不知道您有遇到过吗，还有通过mpi运行maker是否要用module先加载mpi，我是没有加载的

使用MAKER进行注释: 理解的MAKER的并行化

MAKER并行分为两种，一种基于MPI，运行方式为mpiexec -n 线程数 maker, 一种是在同一个项目中运行多次maker。前者需要在安装MAKER时进行设置，后者...

xuzhougeng

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小范809

我用水稻的基因组（大概350MB），在第三步都运行好几天，想知道你这一步大概用了多久，-P 1，这个参数我用的是1

整理一下重复序列屏蔽

由于之前利用repeatmasker自身的lib进行屏蔽时发现，lib里没有我研究的物种，要是不指定物种的话，repeat的鉴别率只有2.16%。所以自由自己建repeat数...

多啦A梦的时光机_648d

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小范809

conda可以安转4.0版本
conda install -c bioconda gatk4

Linux 系统安装 gatk4.0 并设置环境变量

conda install gatk 只能安装3.0版本，如果需要4.0，只能老老实实自己下载安装。 1、下载4.0+版本 wget https://github.com/b...

铃_0d92

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