240 发简信
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  • load("TCGA-CHOL_gdc.Rdata")
    load的这几个没有,演示不了啊。。。

    3大差异分析r包:DESeq2、edgeR和limma

    做差异分析需要的数据:表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了,因为其TCGA的样本ID比较特殊,样本ID的第14和15位是>=10还是<10就代表了这个样本是正常...

  • load("tcga-kirc-raw.Rdata")
    load("DEG.Rdata")
    source("3-plotfunction.R")
    老师,这三个怎么来的啊?

    实战:TCGA数据差异分析三大R包及其结果对比

    原本还有第四个部分,小洁老师讲了另一个R包下载表达矩阵和临床信息的,TCGA-4.使用RTCGA包获取数据但是这个包有个缺点就是数据更新不及时,因此当时看到时候我就没有跟学了...

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    3大差异分析r包:DESeq2、edgeR和limma

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