发简信
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worklog——pindel，GATK，delly使用pindel： 需要文件：sort过的bam文件；.fa的参考文件；config.txt文件（主要是用于标准化bam文件）；bam.bai文件；...
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学习——pindel,delly,GATK安装
（一）pindel安装 1)安装htslib:git clonehttps://github.com/samtools/htslib https...
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学习——测序数据整理工作数据内容：在肿瘤测序数据中，发现血系变异与体细胞变异的叠加 数据来源：TCGA 数据理解： ①TCGA数据产生过程： ②主要数据的分析: 数据操...
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学习——入门知识记录1
目前基因测序工作中主要存在三个问题： question1：精确控制问题，其中主要是质量控制问题。 是由于目前基因测序中存在很多种算法，但是不同的...
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基因测序环境配置过程
安装环境： ubuntu16.04 步骤一：安装R语言 步骤二：安装CloneVB_1.0.tar 步骤三：安装samtloos 安装地址：ht...