在单细胞数据中,整合方法是我们用到的最常用的算法,至于函数当然是FindIntegrationAnchors,但是其中有些内容我们需要深入了解一下,在这里我们就需要来弄明白整...
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你好,谢谢分享,收益良多。
我有个问题想请教一下,spaceranger运行的时候需要提供一个probe_set.csv文件,请问这个文件是做什么用的?
【10X空间转录组Visium】(一)Space Ranger 1.0.0(更新于20191205)今天是2019月12月3日,10X空间转录组的新流程发布了,比起安装旧版的ST Spatial系列好装了太多太多。。。跟以前各个系列的Cell Ranger一样,可以生成FA...
请问这个ids 文件哪里去搞呢?我看了一下manual,st_pipeline是需要这个参数的,但是我从SRA下载的数据只有fastq
ST Pipeline||空间转录组分析流程ST Pipeline: an automated pipeline for spatial mapping of unique transcripts 我们终于可以看到单个...