论文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
发简信
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跟着Nature Genetics学作图：R语言ggpairs散点图一次性展示很多个主成分 -
盘点2022年孟德尔随机化高分文章
都2022年了，竟然还有孟德尔随机化能发IF > 10的文章！！！敲黑板，重点：所用数据全都是公共数据，完全可以复现！！！孟德尔随机化YYDS欢迎留言，大家一起总结一下202...
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复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day3话不多说，直接上代码 部分结果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10，因此都纳入分析中 step 6. 异质性检测结果 p = 0.3858222 > 0...
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复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day1
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzheimer's Disease L...
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哎，用过这个软件，只能说提供的chain file有bug…后来用dbsnp的match找了一遍，用的两个overlap结果……
做研究用hg19orhg38基因组？一行代码将bw转hg38
有没有想过这个问题：做研究的时候该用hg19还是hg38基因组？ 人类基因组版本现状 1）hg19 -> hg38，例如文献中使用的是hg19，你自己的测序数据是hg38 2...
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GWAS与基因表达量的联合分析前言 我们知道GWAS描述的是snp与表型之间的关系，即利用线性模型寻找与某种性状显著相关联的位点。但是发挥生物学功能的往往是蛋白质，蛋白质是由转录本翻译而来，那么建立基因表...
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所以每一批提交的job必须全部做完才能提交下一批？
多行命令并行管理，只需要一个脚本
在上游分析中，多个样本常常要同时分析，为了节省时间我们常常会通过写一个简单的脚本去运行。 比如对于这样的一个accessionlist，样本数较少 我们先写一个比对的脚本 重...
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很多帖子被下架了。以后开直播带货吧。写不动技术贴了。
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Evolution is great!
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实战-TCGA数据的NMF聚类和可视化0.NMF NMF是非负矩阵分解，也是常用的划分亚组（亚型）的聚类方法之一咯。 代码主要参考了帮助文档和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
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GWAS基本建模原理混合线性模型 我们说的混合线性模型主要是由固定效应和随机效应所构成的，固定效应是我们主要研究的影响因素，而随机效应是潜在的，影响固定效应的因素。对于混合线性模型来说，随机效应...
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你好，这个软件下载链接能提供一下吗，找不到啊
简短介绍下如何用GCE确定GWAS阈值
GWAS大家都很熟悉了，随着目前越来越多的重测序文章的发表，可见如今SNP数据是非常的丰富，以及GWAS也发展了15年了，如今到了一个后GWAS时代。GWAS我也做了很多了，...
