trim_galore要运行多久啊,我的运行了一下午了还没有gz文件
Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据,数据质量都很好,给了我一个错觉质控的前后差别不是很大,内心里对质控这一步也就不是很重视,跑完质控有时也懒得看结果,拿到一批测序数据后,也总是忽略了去看测...
trim_galore要运行多久啊,我的运行了一下午了还没有gz文件
Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据,数据质量都很好,给了我一个错觉质控的前后差别不是很大,内心里对质控这一步也就不是很重视,跑完质控有时也懒得看结果,拿到一批测序数据后,也总是忽略了去看测...
刘小泽写于19.2.16今天内容比较简单,易上手:看看如何作图评价定量结果 使用Trinity组装转录本,并定量后,有了基因或者转录本的表达量矩阵,先不用着急去做差异分析,可...
对于不同数据集合的比较的可视化,一般用韦恩图来表示,但是数据集合太多了,就不好看了,反而不容易从图中获得信息了。 三个集合看起来最合适。 2012年发表的香蕉基因组文章中的韦...
分析基因表达量和预后的关系大体思路为:找出某一癌症中感兴趣的基因表达量和病人生存时间的数据,再进行生存分析,画图 分解起来看 第一步:得到基因表达量和病人生存时间相应的数据 ...
一.对于TXT文件 1.对于简单文件,可以简单读取,ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.对于复杂文件,ex1 <-read.table("文件名如e...
PCA(Principal Component Analysis)主成分分析, 用来考察多个变量间相关性一种多元统计方法,研究如何通过少数几个主成分来揭示多个变量间的内部结构...
热图(Heatmap):用颜色变化直观的表达数据之间差异的图,是对实验数据进行质制和差异数据的展现,是数据挖掘类文章的标配。 例如上图,每个小方格表示每个基因,其颜色表示该基...
一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的,对于读取excel,此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...
生物信息学分析和作图是科研狗们的必备技能。近几年,随着数据类型的增多,excel、SPSS等常用软件已经不能满足科研需求了。R语言以其方便、快捷的优势,迅速获得许多编程技术不...