分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础上，开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
IP属地：安大略
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群体遗传学与重测序分析 -
R数据可视化12:曼哈顿图曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线：高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示，今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
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2021-01-03如何绘制选择性清除图（fst、pi、tajimad等）、）一、转载https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/109323644 vcftools --vcf AxiomGT1.call...
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Structure图的构建与理解
介绍 什么是structure图？ 如果你有看过群体遗传相关的文章，你对它肯定不会陌生。对那些还没有接触过的同学，那就直接上图吧： 上图是选取于一个大麦群体遗传的研究。不同的...
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连锁不平衡以及连锁不平衡衰减[连锁不平衡粗俗的说就是：这几个基因耍流氓，喜欢抱团遗传，不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上，随着物理距离的增大，两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减图...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常见的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者...
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机器学习(Machine Learning)&深度学习(Deep Learning)资料(Chapter 1)
机器学习(Machine Learning)&深度学习(Deep Learning)资料(Chapter 1) 注:机器学习资料篇目一共500条,篇目二开始更新 希望转载的朋...
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临床生物信息学中的GWAS分析今天要分享的是一本合集Clinical Bioinformatics临床生物信息学实验指南中的第五章Bioinformatics Challenges in Genome-W...
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Smart is the new Sexy
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STEP2：文献阅读
“ Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression ...
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STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观，所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析，挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合，或者显著差异表达的基因集合等等。...
