关于sva包 sva的用户说明：http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/sva/inst/do...
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R包sva去除批次效应 -
性豁达，擅言谈，阔家子也
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差异分析工具STAMP手册1：Linux版安装关于STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)已经有很多介绍了，如微生物组间差异分析的神器——STAMP(2016...
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读懂你的肠道 | 共生菌和致病菌与肠道黏膜屏障间的互作摘要 ① 肠道共生菌酵解膳食纤维生成短链脂肪酸，供给肠道细胞能量② 肠道细胞分泌黏液覆盖上皮粘膜层，共同构成肠粘膜屏障， 黏液中含有的IgA和抗菌肽(antibacteria...
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R语言常用配色大全R内置基本配色 R自带的grDevices包含有以下调色板： R中色彩相关的函数 使用RColorBrewer包配色 使用colorRampPalette()函数可以扩展颜色...
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Qiime2(二)-将16S 数据导入QIIME 21.双端数据 1.1 原始数据样品路径清单（file path）文件的准备 该文件包含首行、每个样本的 ID、rawreads文件路径、forward或reverse信息。...
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最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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共线性分析 | MCscan (Python version JCVI 包)共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。今天主要测试的是Python版McScan（jcvi工具包），这个包很强大，是从MCScanx升级而来的基因组共线性分析软件。 ...
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世上最强大的科研工具手册本文转载自网络 ，经过简单整理和标注。笔者自己亲测过的靠谱工具已用斜体加粗标注。同时加入了一些适合国内环境的工具/网站。本文不断更新中，希望有能力的朋友可以到这个网页共同完善...
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表位预测软件NetChop、NetCTL、NetMHC及IEDB的使用
1. 网页版工具地址 Predictions of proteasomal cleavage： NetChop 3.1 Server：http://www.cbs.dtu.d...
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samtools view 使用小结整理高通量测序中使用的软件。 samtools是常用的对sam/bam文件操作的工具，其中samtools view命令可以实现查看序列、sam-bam文件转换、过滤序列等功...
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Trimmomatic 安装及初步使用
mkdir Trimmomatic#新建文件夹 cd Trimmomatic#进入文件夹 wget http://www.usadellab.org/cms/uploads/...
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R将数据框内相同变量的数据相加1. 问题 有的时候从原始数据读入到R中的数据会有很多的重复数据，并没有进行数据合并，对于后续的处理中会造成麻烦，因为R处理这种数据的时候会只取用第一次出现的结果。处理这个问...
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