关于sva包 sva的用户说明:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/sva/inst/do...
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关于STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)已经有很多介绍了,如微生物组间差异分析的神器——STAMP(2016...
摘要 ① 肠道共生菌酵解膳食纤维生成短链脂肪酸,供给肠道细胞能量② 肠道细胞分泌黏液覆盖上皮粘膜层,共同构成肠粘膜屏障, 黏液中含有的IgA和抗菌肽(antibacteria...
R内置基本配色 R自带的grDevices包含有以下调色板: R中色彩相关的函数 使用RColorBrewer包配色 使用colorRampPalette()函数可以扩展颜色...
1.双端数据 1.1 原始数据样品路径清单(file path)文件的准备 该文件包含首行、每个样本的 ID、rawreads文件路径、forward或reverse信息。...
共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。今天主要测试的是Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,是从MCScanx升级而来的基因组共线性分析软件。 ...
本文转载自网络 ,经过简单整理和标注。笔者自己亲测过的靠谱工具已用斜体加粗标注。同时加入了一些适合国内环境的工具/网站。本文不断更新中,希望有能力的朋友可以到这个网页共同完善...
1. 网页版工具地址 Predictions of proteasomal cleavage: NetChop 3.1 Server:http://www.cbs.dtu.d...
整理高通量测序中使用的软件。 samtools是常用的对sam/bam文件操作的工具,其中samtools view命令可以实现查看序列、sam-bam文件转换、过滤序列等功...