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    Python安装pyradiomics报错

    报错无法构建SimpleITK包 处理办法比较简单,安装一个较低版本的SimpleITK即可,实测1.2.4可用。 该报错处理过程来自CSDN博...

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    【影像组学从0单排】如何处理shape长度大于3的图像

    处理大量医学影像的时候,可能会夹杂一些非CT或者MRI的影像,从而导致批量的循环报错,比如在一堆CT中掺杂了一个重建图像: 通过读取文件的hea...

  • Python中merge函数的用法

    示例代码如下: 输出的结果如下: 总结一下,内连接就是取交集,外连接取并集,左连接和右连接是按其中某个的行去merge。

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    python安装导入openslide报错

    做病理组学研究,需要安装和导入openslide包,但是这个包比较特殊,安装起来比较麻烦。记录如下。 安装 最开始通过conda安装,换了几个c...

  • 扫描服务器上未占用的端口并用于python

    扫描端口 下载好Xshell后,再下载安装一个nmap插件。下载地址: 安装完成后,打开shell,不用登录服务器,直接在本地运行命令 -p 参...

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    连接服务器 通过xshell连接到服务器。 配置环境并安装依赖 在xshell中新建一个环境 创建完环境后,需要执行conda init命令来初...

  • R语言biomart包获取小鼠的基因长度

    接上回的故事,公司给了新一批的数据,但是批次效应比较重,需要去批次。去批次之后,fpkm出现了负值,但是counts在很多分析里不能直接用,所以...

  • R语言读入表格报错

    师姐发我新的转录组数据让我处理,是一个103M的txt文件,我的小电脑跑得慢,就尝试直接用R读进来试一下。 但是出现了如下的报错: 我一开始没注...

  • pyradiomics报错“Inputs do not occupy the same physical space”

    今天遇到pyradiomics的一个新报错,记录一下还是在提取特征的时候,弹出了报错: 关键的字段是“Inputs do not occupy ...