研究背景 黄瓜（Cucumis sativus L.）（2n=2x=14）是世界上重要的蔬菜作物，在驯化过程中经历了进化瓶颈，因此其遗传基础尤其狭窄。陈劲枫教授团队将栽培黄瓜...
发简信
IP属地：江苏
-
2021《Advanced Science》世界首例人工合成异源四倍体“金瓜”基因组揭示多倍化机制 -
-
-
Linux生信练习4-vcf
作业原文:VCF格式文件的shell小练习 | 生信菜鸟团 原始数据准备 Q1 把突变记录的vcf文件区分成 INDEL和SNP条目 Q2 统计INDEL和SNP条目的各自的...
-
snp数据PCA分析1.质控和LD过滤 1.1 质控:删除信息缺失严重的个体和位点 plink2 --vcf zy_bsz-bi.vcf --mind 0.10 --maf 0.05 --gen...
-
群体结构——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也称主分量分析，旨在利用降维的思想，把多指标转化为少数几个综合指标。 在统计...
-
使用python从cds或蛋白质fasta文件中提取最长转录本
提取最长转录本是一个常见的功能,本脚本会生产两个文件maxpep文件为仅含有最长转录本的fasta文件,maxpep.list为最长转录本的列表原文件格式如下,这是其中一个基...
-
-
深度学习框架PyTorch入门与实践：第三章 Tensor和autograd几乎所有的深度学习框架背后的设计核心都是张量和计算图，PyTorch也不例外，本章我们将学习PyTorch中的张量系统（Tensor）和自动微分系统（autograd）。 3...
-
PyTorch入门学习（一）：What is PyTorch?
未经允许，不得转载，谢谢~~ PyTorch是一个深度学习的框架。简单记录整理。 Pytorch是什么 基于Python的科学计算包： 代替numpy能使用GPU进行计算 灵...
-
python | Python基础教程
一 写在前面 未经允许，不得转载，谢谢~~ 接触Python应该有一年多的时间了，凭借着C++的经验也没有认真地系统地学习过Python就直接上手了~ 目前用的还算可以，但总...
-
与阳光共进早餐<br><br>2024要重新加油<br>最近恢复更新啦，期待多多交流耶～～<br><br>欢迎大家邮件找我讨论学术问题<br>个人主页：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fyuqianfu.com%2F" target="_blank">http://yuqianfu.com/</a><br><br>永远热爱生活<br>永远热泪盈眶<br>
-
-
Pytorch 入门系列（一）前言 1. 深度学习框架的简单介绍1.1 主流深度学习框架1.2 为什么选择Pytorch1.3 Pytorch 的安装 2. Pytorch 的简单入门2.1 张量的概念2...
-
生信基础（二）生信学习资料
原创： hxj7 上次谈到生信人员需要熟练掌握一些编程语言，还讲了Perl和Python的选择问题。那么，如果已经选定了一门编程语言，到底该如何学习它呢？今天的我们可以通过M...
-
简书笔记汇总
以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...
-
HaploMerger2: 从高杂合二倍体基因组组装中重建单倍型本文只是按照自己的需求翻译了HaploMerger2提供的手册部分内容。HaploMerger2的帮助文档写的非常好，一定要花点时间去读啊！ HaploMerger2的分析流...
-
-
综合性突变危害性预测软件
基于测序数据得到的候选变异，如何判定突变是否有害呢？准确区分中性突变与致病突变对遗传病的临床检测有着重要的意义，研究表明，对于单个样本的外显子数据，即使过滤了群体频率（小于1...
-
本博客纯属胡说八道，有疑问还请自行翻阅相关资料
