研究背景 黄瓜（Cucumis sativus L.）（2n=2x=14）是世界上重要的蔬菜作物，在驯化过程中经历了进化瓶颈，因此其遗传基础尤其狭窄。陈劲枫教授团队将栽培黄瓜...
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2021《Advanced Science》世界首例人工合成异源四倍体“金瓜”基因组揭示多倍化机制 -
Linux生信练习4-vcf
作业原文:VCF格式文件的shell小练习 | 生信菜鸟团 原始数据准备 Q1 把突变记录的vcf文件区分成 INDEL和SNP条目 Q2 统计INDEL和SNP条目的各自的...
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snp数据PCA分析1.质控和LD过滤 1.1 质控:删除信息缺失严重的个体和位点 plink2 --vcf zy_bsz-bi.vcf --mind 0.10 --maf 0.05 --gen...
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群体结构——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也称主分量分析，旨在利用降维的思想，把多指标转化为少数几个综合指标。 在统计...
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使用python从cds或蛋白质fasta文件中提取最长转录本
提取最长转录本是一个常见的功能,本脚本会生产两个文件maxpep文件为仅含有最长转录本的fasta文件,maxpep.list为最长转录本的列表原文件格式如下,这是其中一个基...
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深度学习框架PyTorch入门与实践：第三章 Tensor和autograd几乎所有的深度学习框架背后的设计核心都是张量和计算图，PyTorch也不例外，本章我们将学习PyTorch中的张量系统（Tensor）和自动微分系统（autograd）。 3...
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PyTorch入门学习（一）：What is PyTorch?
未经允许，不得转载，谢谢~~ PyTorch是一个深度学习的框架。简单记录整理。 Pytorch是什么 基于Python的科学计算包： 代替numpy能使用GPU进行计算 灵...
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python | Python基础教程
一 写在前面 未经允许，不得转载，谢谢~~ 接触Python应该有一年多的时间了，凭借着C++的经验也没有认真地系统地学习过Python就直接上手了~ 目前用的还算可以，但总...
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Pytorch 入门系列（一）前言 1. 深度学习框架的简单介绍1.1 主流深度学习框架1.2 为什么选择Pytorch1.3 Pytorch 的安装 2. Pytorch 的简单入门2.1 张量的概念2...
