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  • 2024-06-20 QTL-seq从原始数据开始的流程

    步骤1:数据质控: fastp代码如下,保存为fastp.sh 执行fastp命令,批量处理fastq文件 步骤2:call SNP,使用GAT...

  • 2024-03-02从gff文件中获取多区域基因ID

    注意,region.xls和 final_sorted_with_promoter.change.gene文件均为bed格式。bed格式前3列为...

  • 2023-10-20寻找文件并压缩

    将当前目录下大于200Mb,且没有压缩的文件均压缩 这个命令使用find命令来查找当前目录下大于200MB且不以".gz"结尾的文件。然后使用-...

  • 2023-02-20更改vcf.gz 格式文件名称

    如果你想替换特定的样本名称,你可以创建一个包含旧名称和新名称的文件,然后使用bcftools reheader命令进行替换。这个文件的格式应该是...

  • 2023-02-21 安装agricolae报错 non-zero exit status

    安装 R 包agricolae报错:installation of package ‘agricolae’ had non-zero exit ...

  • 2023-02-20 SnpSift 安装及使用

    SnpSift 可以分割染色体,截取部分vcf文件。具体使用方法见:https://blog.csdn.net/weixin_43569478/...

  • 2022-06-22VCF中提取指定区域的SNP

    awk '2<42767716 {print 4"\t"$5}' >R04_R4_1.vcf

  • 2022-06-21EXCEL批量转pdf

    import osimport xlwings as xw def excel2pdf(file):app = xw.App(visible=T...