1.数据准备(以CYP450为例)a.CYP450隐马尔可夫模型(hmm模型)准备Pfam数据库:http://pfam-legacy.xfam.org/[http://pf...
首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具,给生信分析带来了极大的便利,详细内容介绍请参考https://www.jianshu.com/p/f39bff6c4746 一 ...
首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具,为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白,在做多物种间共线性分析时,尝试了多种方法,苦于没有计算机基础,一直没能完成...
当通过qpcr验证基因表达是否与转录组数据一致,通常通过柱形图与折线图叠加的方式呈现,今天记录下步骤。 软件:Graphpad步骤1.输入qpcr与转录组数据表达量,格式如下...
写在前面 不知道大家都是怎么完成qPCR的计算的,在不会R的时候,我是用一个祖传的Excel表进行计算的。🤣但是,一直有个缺点,如果需要计算的量比较大时,就不方便了,去搜了一...
写在前面 2021年,新年第一天,我在忙着家里事情的间隙,分成五次(每次大概30min),录制了 TBtools 的热图(Heatmap)功能的介绍与参数详解。 TBtool...
森严森语: 最近的一些学习和经历,让我产生一种很强烈的认知,那就是由于严重缺乏对身边触手可及的事物的了解,而导致在学习和生活过程中不能产生最大化的生产力。常表现的一种具体的现...
写在前面 TBtools 基本涵盖了基因家族分析所常见的所有分析与可视化功能,其中最为独特的 莫过于 Gene Structure View (Advanced) 几乎覆盖了...
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
多组学研究思路以及写作 非生物胁迫 类型干旱胁迫、盐胁迫、低温胁迫、高光/UV-B胁迫、高温、重金属、机械损伤、营养缺乏等 影响地理分布、产量、粮食安全 大牛朱健康、巩志忠、...
放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的...
生物与计算机的结合让生物进入大数据时代,为方便管理各种生物数据,科学家们开发了各式各样的生物数据库。了解与自己研究领域相关的数据库,并加以利用可能会使研究工作得到事半功倍的效...
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...