大家好啊，这里是佳奥。 一直想有机会学习一下生信分析，一方面是提升自己的技能面，一方面是现在发文章的必须要求了。（目前做植物生理方面） 所以，综上所述，暑假是一个很好的时间与...
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【R实战 入门】从安装到散点图绘制 -
利用Ensembl,UCSC,JASPAR数据库进行斑马鱼启动子区域转录因子分析【壹】 进入 Ensembl genome browser[http://www.baidu.com/link?url=m83OoolLmahPEMzRUaYjqrmZDP...
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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fastq。 DNA甲基化及CpG岛定...
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RNA甲基化修饰m6A检测热门技术—MeRIP-seqm6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式，它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq（高通量测序法）作为m6A修饰的检测方法，其具有针对全基因组范围内检测m6A...
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查询一个基因启动子区域的CpG岛
查询某一基因启动子区域的CpG岛，一般有两种方法：一种是查文献，看您关注的基因，别人做的CpG岛是哪些，这个对自己选择位点有指导作用；另一种是UCSC数据库中查找，这种方法可...
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安利两个超好用的浏览器插件本文首发于我的公众号「效率工具指南」文/彭宏豪 Hello 各位好，我是小豪。 以前我是一个插件控，时不时就会给浏览器装各种插件。 当然，插件在提升浏览器或上网体验的同时，也...
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如何预测转录因子靶基因！
做完转录组分析完之后，一般会找到一些差异表达的基因。差异表达基因中如果有转录因子的话，可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达。要预测转录因子调控的靶基因，需要两个步骤： 1....
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绘制基因染色体位置图
最近，MapGene2Chrom web v2（http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/）偶有“歇菜”，让我们想简单的画画基因的染色体位置图都不方便。在这...
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5分钟看懂KEGG代谢通路图
做过转录组的同学肯定对KEGG代谢通路图不陌生，今天就跟大家分享怎么看懂KEGG代谢通路图，ko、map等开头的代谢图有啥区别？里面的点、线、不同颜色都代表什么含义。 KEG...
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热图竟然还能用Excel来画？数据分析处理的过程中，绝大部分的科研工作者，都会存在利用数据绘制热图的需求。如果你会编程，利用R、MATLAB等，完成热图的绘制轻轻松松没烦恼，其次你还可以利用热图绘制软件完...
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转录组文章怎么写能发2区文章？随着测序成本的下降，转录组测序已经逐步成为分子生物学实验的标配，每年有大量的数据产出，这也导致了转录组测序分析的文章越来越难以发表。 今天小编就给大家带来一篇今年10月份见刊...
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如何绘制漂亮的多重序列比对图
由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.aln文件，可读性差，无法满足高质量期刊的要求。因此，在实际操作过程中，需要对一些多重序列比对的文件进...
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如何快速从转录组数据中筛选目标基因！
如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣的基因等信息。 函数的名称是V...
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绘制差异基因kegg注释图
“差异基因kegg注释图”是转录组分析结果的重要组成部分，能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路，文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异，一定会为你的文章增色不少...
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一个自动获取最新文献的方法！从事科学研究最重要的事情之一就是多读自己研究方向相关的文献，尤其是最新文献。那么有没有什么方法可以自动获取最新文献呢？这里，小编给大家介绍NCBI上的一个自动获取文献的方法。...
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推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具！科研绘图是一项基本技能，之前为大家分享过一期我们组学大讲堂绘图工具合集：收藏贴-绘图工具教程合集-科研必需技能！共20类37种绘图方法，基本涵盖了科研常见绘图需求，喜欢的赶紧...
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转录组分析结果阅读指南测序容易，解读困难 现在大部分同学做转录组实验都是让测序公司去分析，经过了那么多年的发展，公司提供的分析结果也是越来越丰富了，光结题报告就有几十页，结果文件有几百兆甚至超过1...
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CRISPR-Cas9基因编辑不只是剪开DNA这么简单前言 我只是搬运工，这部分内容我参考的内容有：CRISPR Editing is All About DNA Repair MechanismsCRISPR-guideMME...
