大家好啊,这里是佳奥。 一直想有机会学习一下生信分析,一方面是提升自己的技能面,一方面是现在发文章的必须要求了。(目前做植物生理方面) 所以,综上所述,暑假是一个很好的时间与...
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【壹】 进入 Ensembl genome browser[http://www.baidu.com/link?url=m83OoolLmahPEMzRUaYjqrmZDP...
前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据,使用的技术为BS-seq,处理的时候顺带记录了学习过程,演示使用数据为官方提供的example.fastq。 DNA甲基化及CpG岛定...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式,它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq(高通量测序法)作为m6A修饰的检测方法,其具有针对全基因组范围内检测m6A...
查询某一基因启动子区域的CpG岛,一般有两种方法:一种是查文献,看您关注的基因,别人做的CpG岛是哪些,这个对自己选择位点有指导作用;另一种是UCSC数据库中查找,这种方法可...
本文首发于我的公众号「效率工具指南」文/彭宏豪 Hello 各位好,我是小豪。 以前我是一个插件控,时不时就会给浏览器装各种插件。 当然,插件在提升浏览器或上网体验的同时,也...
做完转录组分析完之后,一般会找到一些差异表达的基因。差异表达基因中如果有转录因子的话,可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达。要预测转录因子调控的靶基因,需要两个步骤: 1....
最近,MapGene2Chrom web v2(http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/)偶有“歇菜”,让我们想简单的画画基因的染色体位置图都不方便。在这...
做过转录组的同学肯定对KEGG代谢通路图不陌生,今天就跟大家分享怎么看懂KEGG代谢通路图,ko、map等开头的代谢图有啥区别?里面的点、线、不同颜色都代表什么含义。 KEG...