月底花 - 简书

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ReadAlignChunk_processChunks.cpp:177:processChunks
在运行STAR时，报错如下：ReadAlignChunk_processChunks.cpp:177:processChunks EXITING...

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如何用ENA下载GEO的原始数据
ENA数据路径下载在GEO页面找到BioProject或SRA的编号 SRA数据库下载SRA文件还需要转换，而ENA数据库[https://w...

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文章中不同物种的基因和蛋白的标准命名及写法
小鼠标准命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/gene.shtml[http://ww...

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CUT&Tag数据分析实战-更新
fastqc 0.12.1 [#Nextera Transposase Sequence & PolyG] ktrim 1.5.0 alignm...

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两个Bigwig文件相减
bigwigCompare --bigwig1 teatment_rep1.bw --bigwig2 control_rep1.bw --ope...

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5. Peak 注释
在之前通过macs2得到了差异peaks的数据，现在利用ChIPseeker包进行注释。参考：CS2: BED文件[https://mp.wei...

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4.CUT&Tag 基础分析&数据汇总2
需要文件：seacr/;bam/ 加载R包：输出文件:file1 = left_join(peakN, peakOverlap, by = c...

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3.CUT&Tag 基础分析&数据汇总1
需要文件：bowtie2_summary/;bowtie2_summary/;fragmentLen/;binLen/ 加载R包：设置路径输...

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2.CUT&Tag 数据分析实战（2）
接上回[https://www.jianshu.com/p/1d826a65fd59]，得到 bedgraph 文件了。重要秘籍: In-dep...

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