啦啦啦，每天睡到自然醒吧
发简信
IP属地：湖南
-
DaPars——APA分析3’UTR
Backgroud APA（alternative polyadenylation）在大多数人类基因的转录后调控中发挥着重要作用。通过使用不同的多聚腺苷酸化(poly(A))...
-
IsoformSwitchAnalyzeR 可变剪切分析曾经我用 rMATS 进行可变剪切分析，现在我觉得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyzeR 功能总结如下。 In su...
-
个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
-
基因家族分析（5）：基因家族基因结构可视化本文主要工作：对SBT基因家族的基因结构进行可视化呈现 4.2 基因结构可视化 可视化基因结构，无非就是展示基因区域的组成：3’,5’-UTR，exon或展示CDS，intr...
-
-
-
GFF文件和基因组文件提取mRNA,cds,protein序列首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列，要加-s 参数（能区分正反链...
-
TBtools | 地球最友好的 GFF3/GTF 序列提取工具无论是Windows，MacOS, Linux桌面的用户，你都可以也会使用。 写在前面 伴随基因组测序的普及，越来越多物种的基因组测序项目开展并报道，为科研工作者提供了更为全...
-
微生物组16S rRNA数据分析小结: vsearch
本次笔记内容：vsearch超简介绍install vsearch (linux)常用command vsearch超简介绍 usearch的可靠替代，代码开源，没有数据量大...
-
-
利用minimap2和samtools简化目标基因组拼接
最近打算测一些干燥材料和标本材料的浅层基因组，有些材料降解严重，拼接的过程可能会比较困难。由于我们的目标主要是转录组的数据，所以试试看能不能在拼接之前将与转录组无关的序列直接...
-
多序列比对后可视化的方法
在学习多序列比对的时候一直没学明白，比如一个文件里面有5000+条序列，用一些比对软件比对完好像做不到可视化，怎样能做到在这些序列里面缺失相同的100条序列能够用1条序列表示...
