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育种的基础是具有表型数据。智能检测技术将是未来育种获取数据的最重要的技术手段。 本文 整理基于图片和视频预测动物表型的一些技术要点 基于图片识别和视频预测动物性状的区别主要体...

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目前fine-mapping 针对分子性状 常见的 fine-mapping 软件 SuSiE JAX： 使用Python library - CPU/GPU/TPU (LL...

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全基因组关联研究中的精细作图旨在从一组候选变异中识别出潜在的致病遗传变异，这些变异通常由于连锁不平衡而彼此高度相关。 精细作图采用了多种统计方法，几乎所有方法都基于多元回归框...

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一、比利时的家甲烷育种进展 1. 比利时是最早建立MIR预测甲烷模型的国家 比利时列日大学团队与瓦隆农业研究中心合作，正在推进基于中红外光谱（MIR）预测奶牛甲烷排放（以下简...

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1. 研究背景 随着温室气体减排压力加大，降低奶牛甲烷排放的措施（如饲料添加剂、遗传选育等）日益紧迫。 丹麦2025年5月已发布首批奶牛甲烷排放的育种值。 目前甲烷表型数据集...

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加拿大的GS甲烷减排-可持续指数的开发与应用 加拿大是世界上第一个正式发布国家级的甲烷效率指数，并且应用于实际育种。目前，加拿大已经联合欧洲几个国家开始了进一步验证工作。 1...

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背景及现状 随着全球对温室气体减排和畜牧业可持续发展的关注不断提升，奶牛甲烷排放的遗传育种逐步进入实际应用阶段。当前，许多国家和地区已将甲烷排放作为奶牛育种目标性状之一（虽然...

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文章中图4. Jersey 牛 Ketosis 估计遗传趋势。 背景： 未知亲本组（UPG）根据产地（国家，品种）、年份和选择途径对缺失的亲本关系进行建模（注：我国动物系谱记...

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本文亮点 整合生物信息学和多组学方法对于识别和确定复杂性状和疾病中的因果遗传变异至关重要。 小鼠的Pla2g4e基因案例研究说明了使用调控元件内的SNP来缩小致病变异范围的实...

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研究流程图 摘要 背景 随着动物表型组学（遥感等）和深度表型（多组学数据）分析的快速发展，可以从每个个体获得数千种传统（但也有分子）表型。然而，在动物育种方面，如何处理如此大...

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文章要点 随着遗传数据越来越容易获取，表型分析取代基因分型成为遗传学研究的瓶颈。 使用机器学习（通常称为“人工智能”）生成身体测量值和活动数据的新型可穿戴设备和相机或录音机等...

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亮点 • 与饲料效率和甲烷排放相关的瘤胃微生物群的结果受到所用指数的影响• 特定的瘤胃微生物分类群与每个指数相关• 标准化饲料效率和甲烷排放指标对于准确评估瘤胃微生物群的重要...

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重点 将全基因组关联研究 (GWAS) 与分子数量性状位点 (xQTL)（包括背景依赖性 (cd)-xQTL）跨多个组学水平相结合，有助于揭示 GWAS 信号背后的假定因果基...

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火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...

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综述的主要结论 全基因组序列数据的采用并没有导致对因果变异进行更精细的绘制。 更大的样本量和多样性比更高的变异密度更有利。 多品种全基因组关联研究或荟萃分析提高了检测能力。 ...

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文章名字翻译：通过家畜物种表观基因组数据的调控特征筛选和评估功能变异 摘要 背景： 基因组调控区域中的单核苷酸多态性 (SNP) 和小插入/缺失 (2-50bp) 可能会影响...

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前一段时间进行了Bayes培训，所以想总结和进一步学习Bayes方法。主要是用来估计SNP的效应(GWAS)和应用不同生物信息给SNP权重，提高GP的准确性 Bayes算法简...