功能富集作为生信分析的常规方法,做过分析的人都很熟悉。功能富集的软件也是相当的丰富。其中,DAVID作为功能富集的老牌网站认可度还是很高的,对于...
不得不承认基因的ID种类确实很多,好在常用的就那么几个。做分析基本都会遇到基因ID转换的需求,能用来做这个的事资源还是比较多的。其中,NCBI作...
研究结果表明,在生物过程中以及疾病进展中,不仅细胞亚群内基因表达的变化,细胞类型比例的改变也具有重要意义。为了识别不同生物条件下成分差异的簇,最...
cellxgene是单细胞领域不可多得的资源,作为一个数据库里面目前包含了2124个数据集,囊括1117种细胞类型,共有156M细胞。除了人和小...
scanpy作为单细胞数据分析工具,熟悉python的人应该并不陌生。因其是为复杂的单细胞数据设计而来,所以用于分析bulkRNA数据有点降维打...
单细胞RNA测序极大地丰富了我们对细胞异质性的认识。然而,准确的细胞类型标注仍然是下游分析中的一个主要瓶颈。人工标注耗时费力,很大程度上依赖于专...
前面体验过OmicClaw,感觉还不错,降低了分析数据对写代码的直接依赖。对于不会代码的研究人员来说确实是一种福音,用自然语言即可通过AI操控底...
自从OpenClaw爆火以后,生信分析方向也有不少关于组学数据分析的大模型AI Agent。作为赶时髦的生信工程师,肯定要凑个热闹,感受一下AI...
LIANA+ 是一个可扩展的框架,能够根据需要对现有方法和知识进行调整和拓展,以研究单细胞、空间分辨率以及多模态组学数据中的细胞间通讯。它是 s...