单细胞数据分析经常需要在R与python之间切换，前面介绍过不少工具可以用来将seurat与scanpy对象互转。虽然这些工具也可以转换格式，但...

最近这段时间“养龙虾”很火，听说龙虾可以接管一切，可以帮忙干活，聊聊天就把活干了，这谁能忍住不尝试一下。不过，听说好像龙虾并不好安装，对初学者并...

有些帖子里面预留了脚本的获取方式，在后台回复对应的关键词即可获取，而相应的关键词也在内容里面，大部分读者都可以得到关键词，但还是有些粉丝不清楚，...

单细胞基因组技术能够对跨越时间和空间维度的数百万个细胞进行多模态分析。然而，实验限制阻碍了对细胞在其天然时间动态和空间组织生态位中的全面测量。最...

在异质性组织中识别不同条件下的基因表达差异是一项基础的生物学任务，多条件RNA-seq技术使这一任务成为可能。当前的数据分析方法将组成细胞划分为...

scverse是一个更广泛的软件包生态系统，建立在scverse核心软件包的基础上。这些工具实现了模型和分析方法，以解决空间组学、调控基因组学、...

前面一篇分享了一个读取单细胞数据的工具，有人提到空间转录组是否可用。那么，今天就来分享一个可以快速读取空间转录组h5文件为seurat对象的工具...

软件的专业性最直接的体现方式就是使用起来是否简单高效。单细胞数据分析多了就会遇到一个问题，需要在R与python之间切换，而两种语言常用的保存格...

Squidpy让空间基因表达与组织影像在同一套Python对象里互操作，提供从建图、统计、特征提取、交互式可视化到细胞通讯的端到端工作流。核心功...