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两分组的交集差集可视化最常用的方法就是韦恩图,复杂点如果分组超过5组可以换成upset图展示。虽然也是两分组,但如果有多个分类时韦恩图就不是...
虽然目前有很多语言模型可以替代人工写代码,但并不总是可以直接复制可用,有时候还是需要人工修改以完善可用。拥有学习能力,数据处理并没有会与不会...
Seurat作为知名的单细胞数据分析框架,虽然很好用,但在大数据集一直存在速度上的短板,尤其在FindAllMarkers。所以其一直也在试...
好看的图当然会锦上添花,单细胞美化的包很多,也各有特色,不妨收藏几个,方便以后事半功倍地画出漂亮的图。 scplotter[https://pw...
数据处理时经常需要做各种处理,如标准化和归一化,在R里面可以借助scale函数来轻松完成。默认情况下,该函数做的事情可以用下面的公式概括:其...
每当需要做热图的时候,首先想到就是pheatmap。记不清啥时候第一次使用该包了,但从那以后这就是画热图的第一选择了,因为无论是功能,还是颜...
Seurat的FeaturePlot可以展示基因在降维空间里各个分群的表达情况,也可以展示metadata里面的数据情况,例如基因集打分情况...
分析差异翻译基因时,为了保证结果的正确性,除了使用Xtail软件外,也用riborex分析了一遍,该软件封装了常规转录组常用的三种差异分析框...