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MultiQC作为NGS数据QC报告的整合工具,目前已支持165个生信工具的报告整合,一键就可以轻轻松松将多样本的QC结果整合起来并生成网页报告...
CytoTRACE2是一个新颖的深度学习框架,旨在处理单细胞潜能评估的复杂性,同时实现直接的生物学可解释性。该框架的核心是一组基因集二进制网络 ...
Seurat作为知名的单细胞数据软件,真的是非常棒,让分析过程变得简洁高效,无需花费很多的学习成本便可以上手。虽然该软件是为单细胞数据设计而来,...
单细胞分析前期很重要的一步是细胞类型注释,这一步看似很简单,有时候做起来却是最耗时的一步。如果数据很好,用经典的或者文献里的marker很轻松就...
CellRank是由出品scanpy的Fabian J. Theis 团队开发的单细胞轨迹分析工具,主要用于推断细胞命运的动态变化。传统轨迹推断...
用scanpy做差异分析的时候,发现一个奇怪的现象,如果指定了reference参数,即使设置了pts参数来计算基因的在细胞群里面的表达比例,当...
最近被bwa-mem -T参数搞迷糊了,不明白这个参数是如何发挥效用的。根据软件帮助文档对参数的描述,可知其功能是过滤输出结果,于是乎想当然地觉...