
[Benchmarking Ploidy Estimation Methods for Bulk and Single-Cell Whole G...
最近分析了一批单细胞数据,前期的比对定量使用公司自己的配套软件SeekSoulTools分析,用起来类似于cellranger一行命令完成定量并...
FateID基于迭代监督学习算法,解决了利用细微的转录组差异指示谱系偏差,可以用来概率量化多能祖细胞的命运偏差。FateID基本原理过程如下: ...
endplot算是自己对END-seq数据分析工作的总结和理解。END-seq并不像single-cell广为人知,网上可用的资源满天飞。学...
每当讨论后提出新的分析需求,都有点感觉客户好像在点餐! 生信工程师与厨师,一个整天面对代码和数据,一个整天与锅铲和食材打交道,看似风马牛不相及,...
STAMP (Spatial Transcriptomics Analysis with topic Modeling to uncover s...
MultiQC作为NGS数据QC报告的整合工具,目前已支持165个生信工具的报告整合,一键就可以轻轻松松将多样本的QC结果整合起来并生成网页报告...
CytoTRACE2是一个新颖的深度学习框架,旨在处理单细胞潜能评估的复杂性,同时实现直接的生物学可解释性。该框架的核心是一组基因集二进制网络 ...
Seurat作为知名的单细胞数据软件,真的是非常棒,让分析过程变得简洁高效,无需花费很多的学习成本便可以上手。虽然该软件是为单细胞数据设计而来,...