在做单细胞分析的过程中,我们通常要基于Seurat数据之上做多样化的分析:针对某一子集,重新画图等等。所以,我们首先需要对Seurat的数据结构有一个基本的了解。 下面这个图...
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hi,大家好,不知道大家对算法感不感兴趣,之前我分享了PCA的原理和一些分析技巧,大家可以参考单细胞PCA分析的降维原理[https://www.jianshu.com/p/...
1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集,它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap,找到两者重合的区域。比如求两个peaks的交集,或者看很多...
作者:hony审稿:童蒙编辑:angelica 引言 转眼间,从事生信工作已数年有余。在这期间,一直专注于基因组方面。项目经验较多,涉及的物种也从微生物扩展到动植物,但其中不...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
在分析高通量测序数据的时候,我们会对Q20/Q30不陌生。那么Q20/Q30是什么意思呢?又是怎么来的呢? Q20,Q30它们代表的是某一碱基质量值占全部碱基数的百分比,就类...
Chapter1 什么是统计学(statistics)?统计学是描述一系列可用于描述/整理/解释资料或数据的统计工具和技术。 什么是描述统计(descriptive stat...