这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
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单细胞分析实录(9): 展示marker基因的4种图形（二）
在上一篇中，我已经讲解了展示marker基因的前两种图形，分别是tsne/umap图、热图，感兴趣的读者可以回顾一下。这一节我们继续学习堆叠小提琴图和气泡图。 3. 堆叠小提...
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工具善其事，必先利其器，WIN10 配置wsl2的开发环境前置准备 windows系统：windows 10 专业版（家庭版无法开启虚拟机）windows用户：Administrator (普通用户可能会有莫名其妙的一些问题) WI...
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单细胞PBMC经典细胞类型marker背marker list 不要贪多哦，要慢慢地背，一个一个一个地背，然后背了再很快地忘记，如此反复。 外周血单个核细胞（Peripheral blood mononucle...
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关于GEO的分组矩阵与对比问题
当下载完GEO数据，并做好数据整理后，得到了行名为SYMBOL，列名为SAMPLE的基因表达矩阵（已去重，log2等），现在就要开始进行差异表达分析。分组表达矩阵，告诉代码，...
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ggplot重新画seurat对象的聚类图
参考：https://stackoverflow.com/questions/59101791/seurat-dimplot-highlight-specific-group...
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终于有人把 Docker 讲清楚了，万字详解！
作者：乐章链接：https://www.cnblogs.com/zhangxingeng/p/11236968.html 一、简介 1、了解Docker的前生LXC LXC为...
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Fastq-dump: 一个神奇的软件现在可以用fasterq-dump, 速度更快，请阅读都8102年了，还用fastq-dump，快换fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤...
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TCGA文章复现——LncRNA-CRC预后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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单细胞转录组数据挖掘推荐数据挖掘推荐 单细胞转录组测序（Single-cell RNA Sequencing ）通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太...
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拿到基因表达矩阵之后的那点事(二)上次说了除了FPKM/RPKM标准化，我们可以直接拿原始Counts去进行差异分析，基于Deseq2、edgeR、limma三个包简单介绍一下分析流程。其中edgeR包在无生...
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【转】单细胞 ATAC 测序分析：从数据预处理到假设生成Tips： 这一篇文章，类似单细胞RNA-seq 最佳实践教程，对每一步进行了具体介绍讨论。目前技术和分析方法都出现了好多，看一些综述有一个整体把握。Computationa...
