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发简信
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基础知识 — Exons,Introns,ORF,CDS,UTR,lncRNA,转录本,可变剪切,密码子,启动子,顺式调控元件,转录起始位点,终止子,转录因子,结构基因 -
linux三剑客(grep、sed、awk)基本使用
镜像下载、域名解析、时间同步请点击 阿里云开源镜像站[https://developer.aliyun.com/mirror/?utm_content=g_100030359...
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ATAC-seq分析：Peak Calling（8）
1. 寻找开发区域 ATACseq 的一个共同目标是识别转录因子结合和/或转录机制活跃的无核小体区域。该核小体游离信号对应于小于一个核小体的片段（如 Greenleaf 论文...
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Linux命令学习----less命令
less 作用：查看文件内容，支持交互指令 与more的不同： more浏览文件内容时，只能向后翻看less 浏览支持向前和向后翻看 less语法 less [选项] 文...
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10.12 bwa使用 安装文件路径与使用 sh权限我们这里将用于流程构建的BWA就是其中最优秀的一个，它将BW(Burrows-Wheeler)压缩算法和后缀树相结合，能够让我们以较小的时间和空间代价，获得准确的序列比对结果...
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XP-CLR选择信号
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发...
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2021-01-01-LD杂谈
在重测序发表的文章里面，一般最常见的图中包含以上的LD衰减图。通常可以查看LD的距离来指导后续的单体型图以及将来的育种工作。 要理解LD衰减图，我们就必须先理解连锁不平衡（L...
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GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清单，也许以后有新的方法或者...
