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作者你好,我还有一个问题是,我发现我的ANGES.out文件中有负数,这是代表方向吗,包含负数的我如何处理,因为最后执行如CAR.01.sh的脚本中有负数的会报错,以及10.24向您请教的问题我现在理解了,原来是祖先染色体在物种中的分布,那有办法得到祖先染色体的序列吗
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宏基因组学/群体遗传学 方向
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@深山夕照深秋雨OvO 就是,我的理解是:我九个物种是同一个祖先,我最后出的图不一样就是同一个组先的图吗,那不应该是合并起来画一个统一的图吗(虽然我知道肯定不对,我这里仅阐述思路哈),不然我每个物种都画一个图?那我前面分析的那些比如把多个物种cat到一起难道不是为了后面找到同一个祖先染色体而做的准备吗?作者大大您大概能理解我的疑惑之处吗
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@深山夕照深秋雨OvO 您好,一一对应来画是比如sppA.kary对应sppA.end是吗,因为我看您这代码里写的是sppA.kary对应sppB.end,我最终得到spp1.kary,spp1.end,....spp9.kary,spp9.end,我在一一作图之后,哪个才是我要的结果呢?
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按您的步骤做下来,最后得到了9个.kary和9个.end文件,是一一对应来画吗?
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作者你好,我有9个物种,按你的命名来说是sppA到spp某某,那您最后这个绘图是只能一个一个画吗?难道不是合并起来?但是由于我9个物种内部染色体都是不一样的,我该怎么统一这个结果呢,我是有三个想要分析的物种,还有3个近缘和3个远缘,目的是想找祖先染色体
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