240 发简信
IP属地:广西
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    使用Agora/ANGEs构建祖先核型

    0.部分参考https://doi.org/10.1093/molbev/msae239[https://doi.org/10.1093/mol...

    0.9 7188 14 9
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    从NCBI获取数据直接构建Or.eg.db

    众所周知ClusterProfiler是目前最 马赛克 的富集软件但是除了一些模式物种,大部分物种都没有相应的背景库,非常痛苦 怎么办呢?Ann...

  • 基于gff文件提取最长转录本的信息

    bash get.longest.gff.sh input.gff > longest.gff cat get.longest.gff.sh 有...

  • 使用jcvi绘制共线性时,调整整条染色体的方向

    在使用jcvi绘制共线性时,经常遇到整条染色体反了的情况,比如上图,非常痛苦。 这个时候其实是希望调整方向,把黑线调整为蓝线/绿线的情况。 这里...

  • lastal - 多基因组比对

    -1.refhttps://github.com/gotouerina/Comparative-genomics-script/wiki/03....

  • hyphy absrel的使用

    pal2nal.plhttps://github.com/liaochenlanruo/PAL2NAL[https://github.com/l...

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    (未完待续) 使用NGenomeSyn展示局部共线性

    效果图红色箭头是高亮展示的基因 nucmer比对与输入文件的准备这里我们使用mummer4 cat coords2link.sh 2.软件网址:...

  • 仅作个人笔记 - 使用RepeatMask推断TE的插入时间

    RepeatMask 2.让我们转战R 分歧度 = 突变率 * 分化时间e. g. () 括号里面的是单位8.15% = 26.9 (Mya) ...

  • 统计plink输出的ROH的结果

    0.脚本由大模型生成 鉴定ROH 统计ROH cat stat.ROH.py

个人介绍
宏基因组学/群体遗传学 方向