发简信
IP属地：重庆
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使用Agora/ANGEs构建祖先核型0.忘了是在那篇文献看到的，用了Agora，再把Agora的输出结果喂给ANGEsAgora和ANGEs都是构建祖先核型的软件个人实测是Agor...
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仅作个人笔记 - 使用RepeatMask推断TE的插入时间
RepeatMask 2.让我们转战R 分歧度 = 突变率 * 分化时间e. g. () 括号里面的是单位8.15% = 26.9 (Mya) ...
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统计plink输出的ROH的结果
0.脚本由大模型生成 鉴定ROH 统计ROH cat stat.ROH.py
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统计nucmer的比对结果
脚本由GPT生成运行完nucmer后，想要知道每条染色体的比对情况 cat merge.gap.analyze_alignment.py cat...
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使用SuperRec对染色体进行三维建模/3D chromatin reconstruction0.refhttps://doi.org/10.1186/s12864-019-5470-2[https://doi.org/10.1186/s...
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仅作个人笔记 - 画猫单倍型基因组重组率那种图想画下图中的下半部分，基因组不同位置的重组率ref: https://doi.org/10.1038/s41588-023-01548-y[ht...
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保守loop的鉴定 - 三维基因组
通过三维基因组的分析鉴定了一些loop（染色质环）想看这些染色质环在物种间是不是保守的，或者做一个核心loop，类似于泛基因组 2.保守loop...