山东第一医科大学， 青年教师一枚，三代测序技术爱好者。
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生物信息学数据库导航
生物信息作为计算机与生物的交叉学科，最近几年也受到的大家的关注，因此关于生物信息的数据库越来越多。由于大部分主要为发文章的需求，因此部分数据库并不稳定，没人维护后部分的生物信...
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GO, KEGG, GSEA, WGCNA, and so on...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。 内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习
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有重复样本RNA-seq count数据分析写在前面： 分析之前需要两个文件文件1：countMatrix.txt数据，其中存储着实验组与对照组的基因表达的count值（行是基因，列是样本名）同时注意如果数据里面有缺失...
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学习笔记2021-10-181.权限问题 无法对文件进行操作，显示Permission denied输入 ll 查看，发现文件缺少可执行权限解决方法：chmod 777 file 2.文件不存在 错误提...
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解决安装软件中出现的问题vdb-config --interactive下载数据需解压时安装fastq-dump，结果报错，linux提示需先运行vdb-config interactiveimag...
