由于基因表达调控机制的复杂性，多种组学数据的整合分析，从不同的层面探究生物问题越来越重要。从RNA-Seq层面，我们可以探究哪些基因具有显著差异，上调或下调；从ChIP-Se...
发简信
IP属地：河南
-
第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
-
使用deeptools计算ChIP-seq样本之间的相关性整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 当我们需要评估ChIP-seq类测序数据的相关性时，deeptools[...
-
ChIP-seq实践（非转录因子，非组蛋白）在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
-
软件9 —— MACS2
一、 基本介绍 ※ 峰识别（peak calling）工具包括：MACS2和HOMER（适用于ChIP-seq和ATAC-seq）、HMMRATAC（针对于ATAC-seq...
-
-
【小工具】智能合并测序数据fastq的脚本
介绍： 这是一个可以自动合并数据的简易脚本 应用场景： 有一批数据有三十几个样本,测序公司返回数据时由于数据量不达标，需要加测一次，部分样本数据量还是不够, 又加测一次才够，...
-
【PPT锦囊讲解29】【折线图】告诉你趋势的折线图的高阶玩法今天为大家讲解锦囊29，用折线图表示大趋势！ Step 1：制作标题 1⃣️新建PPT，版式空白 2⃣️插入文本“业务部A员工2015年全年汽车销售情况”，【字号】-【36】...
-
Intervene: BED文件的intersect和绘制韦恩图一、背景介绍 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计：Bedtolols inter...
