
一、人类基因组有多大 参照UCSC提供的hg38版本,也是目前常用的人类参考基因组http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38...
前言 本教程来自与我保存在github[https://github.com/Bioinformatics-rookie/rnaseq_tutorial]上的RNAseq教程...
坐标转换困境 一些公开发表的论文中及很多数据库中经常提到变异,一般变异的表现形式有三种:1)基因组坐标:2)cDNA 坐标;3)蛋白氨基酸坐标。举个例子TP53上的某个变异的...
基因组注释gtf文件或bed6文件转bed12文件 上一篇详细介绍了bed格式,尤其清楚的解释了bed格式中的最后三列,这三列对于理解bed12格式转换至关重要。 本文主要介...
有很多现成的软件可以做,我使用的是gtf2bed用法:在使用gtf2bed的时候,会出现推荐使用convert2bed 命令,具体用法如下: 真实命令: 最后生成的bed如下:
在处理大批量的常见的fastq,fasta数据时,我们常常会使用一些自己写的一些python或者perl的script,但是这类型的script,常常会受限于其速度。此时,就...
Tibbles Tibbles are a modern take on data frames. They keep the features that have stoo...
作者:白介素2 聊一聊引无数英雄竞折腰的 paste函数 来,我们将将镜头推进,仔细的研究一下paste函数 paste函数可用于字符串连接 我们简单举个例子 collaps...
Ruizheng 的学习笔记 感谢 生信技能树 小洁老师 常见报错:找不到文件 文件没有存放于工作目录下(Rprojecct) 拼写错误 (用tab自动补齐) 文件读入的练...