Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...
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Tajima's D 中性检测的指标
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构建系统发生树之软件集锦（更新于2021.01.22）
2020.01.22更新内容，补充了碱基替换模型软件和贝叶斯树软件。 序言：一点笔记整理，希望对看到的同学，老师有所帮助！ 1.复杂的网络状进化树 splittree （1）...
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2018-11-01GWAS实战（四）plink 进阶之数据过滤数据好不好，影响到结果的准确性，所以我们要来对数据进行过滤，过滤前，我们应该对数据的部分特征进行统计描述，以此为依据来进行过滤。 这里介绍的几个指标：1.individual...
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Installing SNPhylo on Linux
这里不写SNPhylo具体安装过程，官网有详细教程,主要谈遇到问题及解决思路。 问题是，给出R package 安装目录那一步，无论是给出安装目录（R中利用library可调...
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你好，请问下你有没有遇到dnadist这一步生成的outfile文件中没有任何东西？
SNP数据构建系统进化树
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
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SNP数据构建系统进化树大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
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R 数据可视化 02 | 火山图
一. 示例数据准备 下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取码：wbk6 文件说明示例数据，其中数据均为...
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MACS2为ATAC-seq callpeak
ATAC-seq作为检测基因组开放位置的重要手段，被越来越多的使用。而其call peak的方法也有很多，这里我们介绍的是MACS。MACS最初被发表是用于ChIP-seq ...
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