SRA数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括 454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos 和 Complete Genomics。除了原始序...
发简信
IP属地：北京
-
下载二代测序，单细胞测序数据SRA，fastq文件等 -
-
高尿酸就等于痛风？你的关于高尿酸的七个误解
尿酸(uricacid)是嘌呤代谢的终末产物，嘌呤代谢紊乱、能量代谢异常及肾脏对尿酸的排泄障碍均可引起血浆尿酸浓度升高(高尿酸血症)或降低(低尿酸血症)。 尿酸1/3是由食物...
-
InterProScan 最强基因功能注释软件 - 最简流程代码参考官方文档，目前 Interproscan 本地版几乎免安装，自带数据库，使用简单。 下载与安装 跳转到软件放置目录 注意到软件依赖 Java11 或者以上 使用软件 蛋白...
-
SRA Toolkit - prefetch 快速下载NCBI SRA数据sratoolkit 是NCBI提供的用于处理来自SRA 数据库测序数据的一个工具包。 #1. sratoolkit 配置 #1.1 sratoolkit 下载 首先，下载最...
-
Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载这个软件： 然后来说这次的流程...
-
R包已上传Github免费给大家使用！差异基因筛选方法：基于基因表达秩序关系识别稳定逆转基因对
2022.3.20 初版2022.3.28 加入代码2022.11.30 免费给大家使用众所周知，差异基因的分析方法有很多种：①普通的差异基因计算方法（limma、edgeR...
-
有测试版链接吗？
IGV-GSAman | 极大提高「功能基因组学」研究效率的基因组浏览器
写在前面 今天周末，转眼10月份只剩一周。万万没想到，一个月下去，我还是花了不少时间在完善「GSAman」。至于为什么本来「两个小时」就干完的事情，可以干成「22天」？到底还...
-
微生物群落的安娜·卡列尼娜原则AKP预测微生物对扰动的反应是微生物学的一个基本挑战。大多数关于微生物组动力学的研究都集中于研究微扰使动物微生物群从健康状态转变为非健康稳定状态的模式。 本文提出了另一种设想，即许...
-
NGS分析手把手教学：零基础RNA-seq转录组分析实践，两套方案(2023年最新）⚠️不想充值付费的小伙伴可以点赞，会随机挑选幸运观众赠送全文。 NGS分析手把手教学系列继WGS全基因组分析[https://www.jianshu.com/p/04cacc...
-
基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
-
每组是三个样品吧？
day53 三组转录组数据分析
学习及参考教程：https://mp.weixin.qq.com/s/uLt-bYCdVcBH6mqoIG_r6w[https://mp.weixin.qq.com/s/uL...
-
ClusterProfiler基因集富集分析，支持基因集物种为什么pathway富集分析结果没有我感兴趣的通路？ 图1 GSEA原理（图片来自plob.org） GSEA分析原理 利用所有基因的表达值，计算每个基因在两个表型（Clas...
-
非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要@(Dayueban)[靶向|非靶向|代谢组学数据分析] 导读 如今组学数据的产出量日益庞大。代谢组学数据也是如此，随着科技的创新和技术的变革，允许科研工作者们通过大样本数据...
-
跟着Nature Communications学作图：R语言ggtree绘制进化树论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
