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R 机器学习预测时间序列模型机器学习在时间序列数据上应用 随着疫情的变化，急性传染病数据经常会随时间变化，我们通过对每天传染病的记录，就形成了时间序列数据，周期可以是天，周，月，年。目前我们经常会用到A...
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admixture 群体结构分析http://dalexander.github.io/admixture/admixture-manual.pdf[http://dalexander.github.io/...
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TCGA数据库 | 临床数据不仅仅只有clinical.tsv其实经常分析TCGA数据库时会发现，clinical.tsv中基本没什么可用信息，大部分数据都是缺失的，那么，如何获取比较全面的临床数据，有哪些常用方法和数据库，一块来看看吧...
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biomaRt: 用R愉快检索BioMart数据库网速慢的原因找到了 R 与 BioMart 数据库的语言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
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您好，请问一下筛选关键基因时，挑选细胞间高度离散的基因，挑选在指定类型间差异表达的基因这两种方法选出来的结果会导致轨迹不一样吗？该如何选择合适的呢？
单细胞分析之发育轨迹分析（monocle2）
大家好，好久没有分享单细胞分析的流程啦，今天给大家分享一个单细胞中常见的分析--细胞发育轨迹分析。之前也给大家分享过RNA velocity，今天就给大家介绍另一个软件包（m...
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运行newCellDataSet函数时的报错
运行newCellDataSet函数时，出现以下报错。 class（cellData）的返回值是[1] "matrix" "array"。 从而猜测是返回类型多了"array...
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Monocle2包学习笔记（一）：Getting Started with Monocle
Monocle包是一个强大的单细胞转录组数据分析工具，它引入了一个对单细胞进行排序的新方法（拟时序分析），通过利用不同细胞转录调控的异步过程，将它们沿着与生物过程（如细胞分化...
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关于read.table读入数据的报错第一个报错 line 1534 did not have 6 elements 起初我的文件如下，用多个空格隔开，除了第五列后面附有“；” 用记事本的替换功能，将“；”替换为...
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scRNA-Seq | Seurat 包原理解析seurat 涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神们分享的帖子，来梳理一下。 一、读入数据。 Read10X(...
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GEO数据挖掘之第一步：数据预处理与差异分析作为一个刚接触生物信息这个专业小白，我正在努力学习着最基础的东西，最先是了解GEO数据库，自己利用数据进行分析，还好之前有R语言基础，这第一步就花了很长时间，但是完成后是很有...
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统计 | 结合clusterProfiler理解GO富集分析OrgDb库 enrichGO默认gene type是entrezID，但其他OrgDb支持的类型（ENSEMBLE，SYMBOL等）都可以通过参数keyType指定。 ge...
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最新7.5分SCI 单基因单肿瘤生信+简单实验大家好，今天要和大家分享的是2021年7月发表的一篇文章：“ERO1L is a Novel and Potential Biomarker in Lung Adenocar...
