以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章,现在整理为流程,同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析。 前处理 拿到原始 fastq 数据先进行前处理。前处理包...
没那么多线程
比对软件STAR的使用在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习另一个很火的软件:STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结合位点TFBS是序列内的loc...
参考文章:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1、view主要功能:sam和bam文件之间相互转换,针对bam文...