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BASALT：优化宏基因组数据的分箱并提高基因组分辨率宏基因组分析这篇文献发表于Nature Communications（2024年3月11日在线发布，DOI: 10.10...

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背景 土壤微生物在砷的生物地球化学循环中发挥关键作用，尤其是通过甲基化将无机砷转化为有机砷。然而，许多参与砷甲基化的微生物仍未被培养或充分研究。本研究结合宏基因组学和宏转录组...

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背景 宏基因组学为研究复杂微生物群落的生物地球化学功能提供了重要工具，但如何选择适当的分析策略（如组装法或直接读取法）对研究结果和资源效率至关重要。本研究探讨这些方法在微生物...

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图1 | 滩涂潮间带沉积物中病毒和微生物的概述。c 潮间带沉积物中溶菌性和溶原性病毒的相对比例。箱线图显示了不同生活方式病毒的相对比例差异。箱线图中的点代表每个采样区域八个样...

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背景 文章的研究背景主要聚焦于乳腺癌（Breast Cancer, BC）与微生物组的关系。乳腺癌是全球最常见的女性癌症之一，且其发病机制复杂，除了遗传因素，环境和生活方式也...

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图1 | 滩涂潮间带沉积物中病毒和微生物的概述。c 潮间带沉积物中溶菌性和溶原性病毒的相对比例。箱线图显示了不同生活方式病毒的相对比例差异。箱线图中的点代表每个采样区域八个样...

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图1 | 滩涂潮间带沉积物中病毒和微生物的概述。b.分类和未分类病毒的比例（左）以及病毒谱系在家族水平上的比例（右）。以下是作图代码： 作图结果： 是两张矢量图进行拼接得到最...

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图1 | 滩涂潮间带沉积物中病毒和微生物的概述。a 采集的潮间带沉积物样品的地理分布。中国的采样省份以灰色表示，包括辽宁省（LN）、山东省（SD）、江苏省（JS）、浙江省（Z...

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背景 潮间带的海滩生态系统是病毒活动的场所，具有显着的生态价值和复杂的生物多样性重要。然而，目前关于潮间带区域病毒多样性的研究尚不充分，尤其是在功能基因和病毒方面-简单方面缺...

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背景 发酵食品在人类改善健康方面受到广泛认可，衍生出丰富的多种丰富的营养成分和生物活性物质。这些食品中重要的代谢物是由生物合成基因簇（BGCs）决定的，具有抗菌、然而，全球食...

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背景 人类破坏破坏组在第一健康和疾病中着眼作用，尤其是在生命早期。高质量的参考基因组对破坏破坏组的分类、重要功能特征分析至关重要。本研究通过分析来自3岁以下儿童的6122个模...

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背景 环境微生物组在首先健康和疾病中发挥重要作用，尤其是在破坏破坏组的研究中。然而，关于微生物组在不同环境中的空间组织调节以及这些组织的基因的了解仍然有限。研究通过建立一个包...

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背景 高分文章的图片看不懂？高分文章的图片好好看！这里对文章中常见的花里胡哨的Circos图进行仔细解读，希望开拓大家对高分文章中图片解读的思路，抛砖引玉一下啦~ 图片绘制 ...

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背景 Picrust2 的 pathway_pipeline.py 脚本是一个复杂的程序，旨在从输入的 KO 层级相对丰度表和 KO 与 KO 的映射关系文件中计算得到 KO...