看里巷人物

iTOL基本用法已经会了，之前记录过一点：系统发育（进化）树绘制小结[https://www.jianshu.com/p/20af7e003d19]。最近重用，调图时又发现了...

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本次笔记分享主要参照 Y大宽和生信札记 的推文以及自己实际用过过程中的一些心得编写！ 一、大致思路 也可以参见：基因家族分析[https://www.jianshu.com/...

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1.首先在Ensemblefungi获取该物种整个基因组的gff注释文件（或gtf注释文件，有谁就下载谁） 2.指定基因id的获取 可以用表格形式打开gff文件，一般指定基因...

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一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析，对于这块自己没有接触过，因此也是一个挑战，没事！！！（安慰自己），对于基因家族的分析网上的教程很多，跟着步骤走就可...

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你问我为啥标题这么长，据说是关键词给的多，容易被搜到。写得不好，不用海涵，直接提出，谢谢您呐~ 1. 前言： 没错，作为一个自以为入门了的人其实还在门外。根据达克效应图解，充...

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转座子鉴定方法 转座子的鉴定方法基本归于两大类：从头预测、基于同源比对。 从头预测算法 de novo 包括：基于基因组序列比对的方法、K-mer 方法、基于结构特征的方法基...

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转座子序列的注释（工具介绍） 关于TE的信息被编目为三种类型的存储库：以TE为中心(TE-centric)，以基因组为中心(genome-centric) 和以多态性为中心(...

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本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信，公众号：我与生信文献分享22：泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠檬酸积累的关键基因[http://mp.weixin.qq....

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之前偶然的一次机会，感觉修改代码画基因图谱入门比较困难，入MapChart和MapDraw。这两个工具，如果你会修改代码了，使用起来还是非常方便，个性化修改图谱也是非常好用的...

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查找玉米各基因位置及各染色体长度教程 1、打开玉米数据库（http://ensembl.gramene.org/Zea_mays/Info/Index）网站，输入想要查找得基...

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文|梁佐佐 会LaTex排版的小伙伴就不必看该贴子啦，这至少能节约你2分钟的阅读时间，题主也是超想学习LaTex的=。= 让我们开始愉快的插入引用文献吧！ 文献管理软件名气排...

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基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...

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写在前面 以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网，手上的...

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为什么要检测 DNA 甲基化？首先，我们为什么要检测 DNA 甲基化呢？检测 DNA 甲基化能回答什么问题？我们都知道，DNA 甲基化可以调控基因表达，因此检测 DNA 甲基...

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写在前面 这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累，主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hub基因就是关键基因，甚至有人认为差异表达基因就是关键基因。在正式看本文章之前...