2023年6月7日，来自北京科技大学，清华大学与中山大学的研究者在biorxiv上发布了一篇题为“OmicVerse: A single pipeline for explo...
IP属地：甘肃
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OmicVerse: 解决整个转录组学分析的Python框架 -
单细胞测序最好的教程（一）：质量控制目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。2023年在 Nat Rev Genet上发表的一篇论文Best ...
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R绘制火山图 EnhancedVolcano+ggplot什么是火山图？ 火山图其实是一种很形象的叫法，它可以通过关注对象的落点从而直观地展示该对象的所属区域。其通常用于展示差异结果，比如RNA-seq差异基因展示。读懂了“火山”火...
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snpEff使用说明（上）-了解及创建SnpEff注释数据库SnpEff是一款注释变异位点（SNP+InDel+MNP）和预测变异对基因的影响（例如氨基酸变化）的工具。 用法： 输入文件：输入是变异位点（SNP，插入，缺失和MNP）的...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2散点栅格化能够减小输出pdf的文件大小论文 A saturated map of common genetic variants associated with human height https://www....
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如何在MAC M1芯片上安装R的Bioconductor包苹果的m1芯片已经出到了第二代的m1pro/max版本了，不少同学也是用上了新的macbook，m1芯片的优点我们已经有目共睹。虽然新版本的R的新版本和cran上的标准包如g...
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数据提取及ggplot2画图
以CLL数据包为例： 1、提取所需数据 2、安装注释包 3、探索探针与基因symbol的对应关系 4、对数据进行筛选，去重： 5、选择对应的数据作图(基础作图)： 6、ggp...
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R语言基础入门(3) select选择列的方法从基础到高级前面的2节介绍了数据的格式转换宽表转长表函数pivot_longer以及行过滤函数filter( )今天来继续介绍列选择函数select( )的使用 选择列:基础 要选择几列...
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Seurat官方教程1 | 整合受刺激与对照PBMC数据集整合受刺激与对照PBMC数据集，以了解细胞类型特异性反应 教程背景 本教程介绍了康等人在2017年提出的两组pbmc。本实验将PBMCs分为受刺激组和对照组，受刺激组给予干扰...
