其实这一部分在前面就已经涉及到一些，不过官网既然把这部分拿出来单独作为一大块讲解，可能也是因为这一部分可供选择的可视化方法有很多。对于图片的优化上也有比较详细的介绍。 官网这...
发简信
IP属地：广西
-
利用scanpy进行单细胞测序分析（三）Marker基因的可视化 -
单细胞中应该如何做GSVA？此前我们已经花了三篇推送的篇幅去详细介绍了GSVA： 文献阅读系列（九）、一文了解GSVA原理[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwMzI...
-
Seurat Weekly NO.06 || 数据对象转化之Scanpy2SeuratSeurat Weekly NO.0 || 开刊词[https://www.jianshu.com/p/6f88d3df702b] Seurat Weekly NO.1 ||...
-
单细胞分析之细胞交互-1：CellphoneDB常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
-
单细胞数据挖掘||DOSE：疾病本体论语义相似分析在拿到单细胞数据之后，我们指的跑完了cellranger 、scater、singleR、 seurat、monocle这些培训班老师带你走完的流程之后，要进一步的挖掘或者辅...
-
单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类scanpy 是一个用于分析单细胞转录组（single cell rna sequencing)数据的python库，文章2018发表在Genome Biology。其实它的...
-
Scanpy数据结构：AnnDataAnnData是python中存储单细胞数据的一种格式 1. AnnData数据结构： 主要包含四个slots：X contains the expression matri...
-
【单细胞测序数据分析-1】认识Seurat对象数据结构/数据格式及操作一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构成，对象的调用、操作，常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...
-
Monocle3：拟时序分析写在前面：今天突然想写这个教程，花了一下午看资料，其实我前面是有一些基础的，但是看的还是会很乱，所以想把这个包的脉络写一下，希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
