森尼啊

一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构成，对象的调用、操作，常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...

生信阿拉丁

作者：Jenny审稿：童蒙编辑：amethyst ChromHMM是2012年由来自麻省理工学院布罗德研究所和美国马萨诸塞州剑桥市哈佛大学Jason Ernst和Manoli...

刘小泽

刘小泽写于2020.8.5今天跟着官方文档来看看GRanges这个对象 1 前言 内容来自：https://bioconductor.org/packages/release...

生信start_site

前面的学习笔记里，对于scATAC-seq的分析，使用的是signac R包进行的。前几天在一次偶然的机会里，有幸和一个专门做生信的老外聊了聊（纽约某校的PI），从他那里听说...

尧小飞

1. 目的   最近在某个分析的时候，需要BSgenome object，然而我的物种不是常见的物种，是自己组装出来的多倍体物种，因此没法用已有的BSgenome参考基因组，...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，今天已经是五一假期的第二天，本人呢，哪也去不了，只好在家歇着，所以呢，给自己找点事做，本人93年，单身，现居天津武清，女孩子有没有想谈恋爱了，可以联系我，...

whitebird

一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后，还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...

小白要变大神

和featurecounts一样，htseq-count也是一款进行raw count定量的软件。该软件采用python语言进行开发，集成在HTseq这个包中。 对于pyth...