刘小泽写于2020.8.5今天跟着官方文档来看看GRanges这个对象 1 前言 内容来自:https://bioconductor.org/packages/release...
刘小泽写于2020.8.5今天跟着官方文档来看看GRanges这个对象 1 前言 内容来自:https://bioconductor.org/packages/release...
前面的学习笔记里,对于scATAC-seq的分析,使用的是signac R包进行的。前几天在一次偶然的机会里,有幸和一个专门做生信的老外聊了聊(纽约某校的PI),从他那里听说...
1. 目的 最近在某个分析的时候,需要BSgenome object,然而我的物种不是常见的物种,是自己组装出来的多倍体物种,因此没法用已有的BSgenome参考基因组,...
hello,大家好,今天已经是五一假期的第二天,本人呢,哪也去不了,只好在家歇着,所以呢,给自己找点事做,本人93年,单身,现居天津武清,女孩子有没有想谈恋爱了,可以联系我,...
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...
和featurecounts一样,htseq-count也是一款进行raw count定量的软件。该软件采用python语言进行开发,集成在HTseq这个包中。 对于pyth...
单细胞文章层出不重,但是数据格式不统一,卡卡在重现大量文章数据的时候发现,有的文章提供的是处理后的单细胞矩阵,而不是原始counts,甚至有的文章提供的数据是scaled...
本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中,所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然,相对于整个系统发育软件之汪洋大海,此处不过一滴水! 1. 数据获取...
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准确,我会在服务器上使用RaxM...