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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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10X单细胞揭示晚期肾细胞癌免疫治疗期间的肿瘤和免疫重编程工作已经进入了正轨，10X单细胞空间似乎永远在路上，但是慢慢研究的风向开始起了变化，单细胞空间都不再满足于对组织的研究，而是要靠向临床，运用单细胞空间技术对临床进行指导，今天...
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富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页在线或者本地化工具派上用场了。...
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蛋白质组学数据分析——（1）原理当前，关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热，网上关于这方面的知识也寥寥无几，从事这一行也有一段时间了，但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训，所以是时候把知识...
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如何在 EndNote 中显示期刊的影响因子影响因子现已成为国际通用的期刊评价指标，不仅是衡量期刊价值和曝光的指标，同时也是衡量期刊的学术水平、以及论文质量的重要指标。就在昨日，即6 月 29 日，科睿唯安(Clari...
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利用Uniprot网站对基因信息名称进行基因Uniprot ID转换前两天介绍了KEEG数据库，我们通过该数据库对单个基因进行信号通路查询，其实我们可以利用KEEG中的“Analysis Tools”中的“KEGGMapper”可以对多个基因...
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可教学（转录组测序、单细胞测序
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ATAC-seq原理与步骤ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing。用...
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R markdown 入门安装教程口胡一段，可忽略 第一次接触到 markdown 这一新鲜事物都是因为简书，直接使用键盘键入字体格式的感觉，对我这样一个喜欢用字处理软件来记笔记的强迫症来讲，实在爽的飞起，...
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ChIP-seq分析的一般流程方法现在ChIP-seq的数据基本是最常见的测序数据类型之一，主要有Transcription factor ChIP-seq和Histone ChIP-seq。前者是看转录因子...
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如何快速了解新接触的质粒(一)
质粒(plasmids)是常用的一种载体(Vecto)，是做分子相关领域永远无法躲避的一道难题，不管做分子克隆，蛋白表达，包装病毒等等都需要用到质粒，所以当你开始一项课题或者...
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从qPCR溶解曲线判断PCR产物的相对大小在做qPCR的时候，40个循环之后，都会插入一步（6）：绘制溶解曲线。 那么，溶解峰会给我们提供什么信息呢？ 上图的三种颜色代表了我三种不同的PCR产物片段（3个基因）从左至...
