本人分子生物学转细胞生物学在读普博生一枚。之前一直对生信有念想（其实是对实验感到心累），但是出于对编程的恐惧（大学时C语言考的最低，有阴影）一直没有开始学习。目前的课题接触到...
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1204 R 数据科学啃书-学习记录
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假设检验之自由度计算
这两天在整理各种检验方法的自由度，突然发现自由度也是一个很有学问的知识。 一、自由度的理解 在统计学中，自由度(degree of freedom, df)是指当以样本的统计...
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有一种神奇的性格叫——INTJ2.3.1 沙箱 要了解 INTJ 的性格，首先要明确一个叫做沙箱的概念。 INTJ，我们从这四个字母就能看出他的性格特点：内向的人本身就不喜欢与人交往，直觉让他们倾向于自己...
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2019-12-22 Day10-14-学习 TCGA数据库单基因文章套路花了5天，把视频看完。顺便整理了一下。IF4.5分左右套路：TCGA数据下载，选择想要研究的基因，然后对基因ID进行转换，提取矩阵中基因表达量，然后做差异表达分析-散点图-疾...
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基因表达分析（中）- 富集分析
回顾 首先对基因表达分析（上）做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具：RNA-Seq，microarray， qRT-PCR等（欢迎补充） RNA-Seq，microar...
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学习小组Day7笔记-qzy第一次为自己冲动的学习而感到庆幸，这一周其实情绪状态都很差，论文很糟糕（只能怪自己），压力很大，小组的学习反而让我能平静下来，没有目的性只是学习，这个课程的设置是教会方法方式...
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学习小组Day6笔记-qzy
R包入门 1.设置镜像 使用R的配置文件.Rprofile 在文件里添加 2.学习dplyr包 2.1 5个函数 3.1管道操作%>% (cmd/ctr + shift + ...
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GO、KEGG富集分析——DAVID与KOBAS在线分析工具在进行差异基因表达分析时，得到显著差异基因后，接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能，常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析，今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAV...
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cBioportal中文教程使用cBioPortal进行复杂的癌症基因组和临床profiles整合分析（Y大宽原创，转载需要说明） 主要来自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...
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学习小组Day5笔记-qzy
R语言数据类型 新手注意需要注意的点： R的代码都是带括号的，括号必须为英文（其他标点也必须为英文）一定要变量保持大小写的统一！！！ 1.向量 1.1向量中提取元素根据元素和...
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学习小组Day4笔记-qzy安装R和R studio（已完成） 基本操作 赋值<-输入(alt+减号) 显示文件列表>dir() >list.files() 加减乘除 删除变量 列出历史命令histor...
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学习小组Day3笔记-qzy下载miniconda wget命令用来从指定的URL下载文件。使用wget下载单个文件 安装过程 命令 最后要记住激活！ source ~/.bashrc 清华镜像 使用c...
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