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这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年,我开始自学生物信息,那个时候,为了加深自己学习,所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客,xu...
这篇笔记是wet实验的笔记,记录了一些有关融合标签的知识点。因为之前没有做过相关实验,在和实验室同学讨论的时候闹了个笑话。。。于是必须把这部分知识补起来。学习材料来源于abc...
为啥我的testrun报错啊?明明就是按照官网的代码来的😭
使用cellranger-atac软件处理10x单细胞ATAC-seq测序数据(上)Cell Ranger ATAC简介 cellranger-atac软件是用于处理10x Genomics平台Chromium Single Cell ATAC-seq测序数...
Barcode Processing 执行此步骤是为了修复条形码(barcode,细胞的标识)中偶尔出现的测序错误,从而使片段与原始条形码相关联,从而提高数据质量。16bp条...
这本书的作者樺澤紫苑也是一位时间管理大师。他告诉我们学习的真正掌握得益于有效的输出。受到作者启发,我觉得从现在开始就来输出吧。其中一句话令人深刻: 输入改变大脑,输出改变世界...
单细胞测序有着漫长的过去,却只有短暂的历史---谁说的! 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了,说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...
GRN:基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost:基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
刚过去的半个月,去武汉参加了陈连福的NGS生物信息分析培训,有很多心得,想记录下来。 培训简介 为什么要参加培训想多学点生物信息学技能,增加自己的竞争力.因为自己喜欢编程,又...
Reducing barriers and accelerating single-cell research https://singlecell.broadinstitu...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
这是我听孟浩巍知乎Live:生信进阶第1课-重复Nature文章和B站视频:高通量测序技术交流录像里的笔记哦~ 目录:文章的主要结论解读传统RNA-Seq建库方法几种主要的单...