对于二代测序，可以使用fastQC[https://github.com/s-andrews/FastQC]软件对原始下机数据质量进行全面的统计及绘图，多样本时可进一步结合使...
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三代测序 - Oxford Nanopore (ONT) 数据分析 - 数据质控和过滤 -
fastx_toolkit
fastx_toolkit由一系列的命令组成，每个命令提供一个实用的小功能。在使用时需要注意以下几点 不支持压缩格式的输入文件 不允许序列中存在N碱基，这样的序列会自动去除 ...
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fatal error: ft2build.h: No such file or directory
遇到在编译 R 包时报错找不到 ft2build.h 这类文件的问题，通常是因为相关的开发库没有正确安装或者安装路径没有被编译器正确识别。针对你提供的命令和错误，这里有几个步...
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基于Conda 安装配置 Jupyter，Mac远程连接
1. Conda 安装及配置 安装文件下载 Linux 下推荐安装 Miniconda3 (基于 Python3)。 Miniconda3 下载链接[https://mirr...
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Trim_galore
Trim_galore自动化过滤数据，十分适合小白，具体来说的话，trim_galore分几步处理数据： Quality trimming; Adaptor trimming...
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echo、tail和重定向符
1.echo命令 在命令行内输出指定内容，输出内容比较复杂的时候，用双引号包括 反引号 反引号包围的是命令，而不是简单输出echo后面的内容 重定向符 重定向符：>和>>（1...
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grep-wc管道符
1.grep命令 可以通过grep命令，从文件中通过关键字过滤文件行语法：grep [-n] 关键字 文件路径 -n可选，表是在结果中显示匹配的行的行号 关键词，建议用""包...
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which-find命令
which 查找所使用的一系列命令的程序文件存放在哪里 find 搜索指定文件find命令 - 按照文件名查找find 起始路径 -name “被查找文件名” find命令 ...
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整个文件生成md5文件
find ./ -type f -print0 | xargs[https://so.csdn.net/so/search?q=xargs&spm=1001.2101.300...
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你好,麻烦请教下bedtools_matrix2是对bedtools_matrix做了什么修改呀
【HiC】绘制TAD边界强度
背景 经常在HiC文章中看到TAD边界强度变化图，大体上可以反映TAD之间隔绝情况,绝缘系数越低，TAD之间交互越弱。如下图： 画图的方法： 有点类似ChIP-seq pe...
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