1. 使用包绘制韦恩图 1.1 两个数据集 1.2 多个数据集(此处以5个为示例) 1.3 交集元素的提取 ★ 5个数据集是VennDiagram包的上限 2. 使用包绘制韦...
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将几个数据集之间的交集进行可视化,除了可以利用Venn图外,还可以使用upset这种图形。这种方法是发表在2014年nature methods上面。Sets and int...
pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包。ComplexHeatmap包即是受之启发而来。你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同。在p...
edgeR and DESeq2, part2-独立过滤 过滤低read计数的基因,又名独立过滤(Independent Filtering)。 ...
学习目标 了解计数数据变换方法的重要性 了解 PCA (principal component analysis) 了解如何使用 PCA 和层次聚类评估样本质量 1. 质控 ...
1.构建DESeq2对象 (1)从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 se为RangedSummarizedExperiment对象...
关于单因素方差分析,网上有很多方法,比如使用R语言进行单因素方差分析以及结果可视化[https://mp.weixin.qq.com/s/PDbuql_ANZVu14Sk6V...
写在前面 本文章参考了多个国内外教程,在这里就不列出来了。这么写的原因还是想告诉大家:本文章并非原创,感谢各位前辈的分享。 加载需要的数据包 本文章用到的数据包中,“tidy...
1. 各种ID名称介绍 Gene ID 也称Entrez ID/EntrezGene ID ,是 NCBI 使用的能够对众多数据库进行联合搜索的搜索引擎, 其对不同的 Gen...