hello,大家好,之前呢,分享了10X单细胞和10X空间转录组的降维算法,不知道大家掌握了多少。今天我们来分享默认的聚类算法Louvain,Louvain算法是目前单细胞分...
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hello,大家好,今天我们来分享一下最新常用的聚类算法----leiden,其实大家在看Seurat的函数FindClusters可能会观察到,其中有一个参数algorit...
免疫组库是哪位? 能够称为“组库”,首先是功能相似的N多细胞的集合。而“免疫”是指免疫细胞,特指T/B淋巴细胞。“So~免疫组库”(Immune Repertoire,IR[...
什么是细胞异质性? 在谈及细胞异质性之前,还是让我们先来看看肿瘤的异质性吧:肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学...
在python中,有一些内置好的特定的方法,这些方法在进行特定的操作时会自动被调用,称之为魔法方法,下面介绍几种常见的魔法方法。 1、__init__:初始化函数,在创建实例...
前几天学习了文献CUT&Tag[https://www.jianshu.com/p/335aec753039],了解了原理以后,可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
导读 宏基因组分箱(Binning)是将宏基因组测序得到的混合了不同生物的序列或序列组装得到的contigs按物种分开归类的过程,类似下图[1]。传统的单物种全基因组序列都是...
示例一:综合操作(ImageMagick命令行)---------------------------------------------------------------...
Scanpy 是一个基于 Python 分析单细胞数据的软件包,内容包括预处理,可视化,聚类,拟时序分析和差异表达分析等。https://genomebiology.biom...