老饕_Ljw

写在前面 引物设计几乎是每个分子实验室的研究生必备的一项技能。目前，已经有许多成熟的引物设计软件供大家使用，如本地版的Primer5以及NCBI上的Primer-BLAST等...

xuzhougeng

Canu简介 目前Canu已经更新到2.0版本，本文用的是Cau1.6版本，一些参数可能存在变动，请注意分辨。 Canu是Celera的继任者，能用于组装PacBio和Nan...

xuzhougeng

使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装 基因组组装大致可以分为三步（1）根据序列之间的重叠情况构建出contig，（2）基于二代的mate pair文库或光学图谱将co...

SnorkelingFan凡潜

推荐首先研读官方github教程 Juicebox Assembly Tools[https://github.com/aidenlab/Juicebox/wiki/Juic...

生物信息与育种

1. 主要纠错类型 上篇HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错？[https://www.jianshu.com/p/66c0a7a2483f]我吐槽了Juice...

生信start_site

最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图，所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是什么？ A: 高通量染色体构象...

生信start_site

最近纽约复工，因为每天要做实验（还得全程戴口罩，非常闷得慌），比不了之前每天都在家可以为所欲为的自学生信，所以更新也少了很多~ Hi-C的技术相关背景学习笔记我在之前有写过（...

花舞lala

首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具，为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白，在做多物种间共线性分析时，尝试了多种方法，苦于没有计算机基础，一直没能完成...

文章收集器

需要准备的内容: 环境：Linux 或 Ubuntu，已经安装openjdk 文件：通过 GATK 流程得到的变异或者 VCF 格式的文件 参考文件：对应基因组版本的 gff...