1.核酸,基因,DNA,染色体,基因组,同源染色体,等位基因 核酸,基因,DNA,染色体 核酸:一种通常位于细胞核内的大型生物分子,主要负责生物体遗传信息的携带和传递。核酸有...
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Computing the Role of Alternative Splicing in Cancer Most human genes undergo alternati...
近日,做差异分析的时候,想着看一下样本本身的特征是以什么分类的,除了计算样本之间的距离,还用到的PCA(主成分分析)。在DESeq2包中专门由一个PCA分析的函数,即plot...
单端测序文件 for i in *IP*fastq; do ~/Software/sortmerna-2.1b/sortmerna --ref /home/zhou/Soft...
BED (Browser Extensible Data)格式文件就是通过规定行的内容来展示注释信息 BED文件每行至少包括chrom,chromStart,chromEnd...
上次我们整理到bwa比对后得到bam文件,下一步我们要通过GATK流程从bam文件中call variant。一、使用GATK前须知事项: 对GATK的测试主要使用的是人类全...
Part0背景知识 Q:什么是外显子测序呢?A:外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。外显子组包含约1%的...
第一步:创建normal样品的PoN(Create a sites-only PoN with CreateSomaticPanelOfNormals) To create ...
GATK现在最新的稳定版已经到了3.8,测试版是4.0。3.8版和之前的版本还是有比较大的不同的,但核心算法与4.0的差异不大,4.0主要整合GATK和picard工具并...
00 写在前面 仅针对人类WGS或WES数据,供参考。时间管理某一点:能自动化的工作尽量自动化,不要时间用在毫无意义的重复上。脑袋好比肌肉,需要不断提高负重的锻炼才能达到“有...
请问一下为什么cutadapt -a AGATCGGAAGAGC -A AGATCGGAAGAGC接的是一样的序列,不是应该-a是三端接头,-A是五端接头的反向互补序列吗
二代测序的数据的分析——质量控制质量控制 测序质量检查-FastQC FastqcFastqc website (http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/proje...